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时空放大镜探寻微观,空间单细胞尽显眼前

2024-04-18
中科新生命
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10x Visium HD空间转录组重磅推出后备受关注,在超高分辨率(2μm)条件下实现全组织覆盖检测,结合创新探针和CytAssist仪器实现高质量的数据检出,为肿瘤免疫微环境、微小区域结果解析和时空异质性研究提供了全新的解决方案。

时空放大镜,破解生命真相!

10x Visium HD空间转录组重磅推出后备受关注,在超高分辨率(2μm)条件下实现全组织覆盖检测,结合创新探针和CytAssist仪器实现高质量的数据检出,为肿瘤免疫微环境、微小区域结果解析和时空异质性研究提供了全新的解决方案。

 

 

下面是4例实测项目数据(人结直肠癌、人肺癌、小鼠脑、小鼠小肠)。官方链接为:

https://mp.weixin.qq.com/s/nHMejxkqtOK6kXDrFNzFJA

https://mp.weixin.qq.com/s/3-XpVoogxO7zS-YEg-GxIA

注:8μm为一个Bin单位,进行数据分析,探针法捕获人的18000+基因,实际检测到18000左右,小鼠的19000+基因,检测到19000左右,Visium HD探针在临床样本捕获效率极高 。

98.8% 及以上的Reads比对到探针集,准确度极高,有效barcode 均达到88%以上,有效 UMI 100%,整体的数据质量非常高且稳定。

 

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HD技术绘制人乳腺癌精细肿瘤微环境景观

视频链接:https://mp.weixin.qq.com/s/HNnvAxezJJjlCdYLLq12dA

 

 

 

 

 

 

 

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