气温骤降，DIA定量蛋白质组发文热度不减，10分以上的DIA文章都在研究什么？

当质谱技术与蛋白质组学碰到了一起，则会产生出强烈的化学反应！十几年的时间，蛋白质组学的研究对象从细胞模型、动物模型，到人的体液、组织等人体样本，应用范围的生物复杂度越来越高。研究目的，也从最初的肽段序列推导，到多肽和蛋白质的定性定量分析，翻译后修饰，再到如今成为新热点的空间层面蛋白质信息挖掘，总之，势不可挡！

常用的基于LC-MS/MS的定量蛋白质组学策略有四种：两种靶向技术方法：选择性/多反应监测（SRM/MRM）和平行反应监测（PRM）体系，以及两种非靶向技术方法：数据依赖性采集（DDA）和数据非依赖性采集（DIA）。DIA数据非依赖采集模式作为DDA模式的延伸和发展，是近几年来兴起的一种新的质谱数据采集方式。DIA主要通过高低碰撞能量进行一级质谱和碎片信息的交替采集，将整个扫描范围划分为若干个可变窗口，将每个窗口内的所有母离子进行碎裂，从而完整地获得样本中所有母离子的全部碎片信息。基于DIA的定量蛋白质组具有通量高、稳定、准确性好等优点，更适合于复杂样本和大规模蛋白质组的定量分析。

中科新生命自2016年开始提供商业化的DIA定量蛋白质组学服务至今，已形成了从高通量检测到分析的完整技术平台，开发了特色激酶分析及与其他组学的联合分析方案，已助力客户发表了几十篇高分文章。接下来，请跟随小编一起看一看近几年的高分客户文章都利用DIA定量蛋白质组做了哪些研究吧！

影响因子：16.6

合作单位：第三军医大学第一附属医院

本研究通过多种方法联合鉴定出肝脏中独特的DUOX2⁺ACE2⁺小胆管细胞，并验证了其减少与PBC疾病严重程度的相关性。此外通过4D DIA蛋白质组定量分析证实了pIgR在DUOX2⁺ACE2⁺小胆管细胞中的高表达。主要结果：

① PBC肝脏单细胞转录组图谱；

② 在人类和小鼠肝脏中发现独特的高表达的DUOX2⁺ACE2⁺小胆管细胞；

③ DUOX2⁺ACE2⁺小胆管细胞数量显著减少与胆汁分泌障碍和PBC严重程度密切相关；

④ PBC发病过程中，免疫应答与肝脏DUOX2⁺ACE2⁺小胆管细胞数量的选择性减少有关，也可能通过细胞-细胞相互作用影响其他类型的胆管细胞；

⑤ pIgR特异性自身抗体可能与DUOX2⁺ACE2⁺小胆管细胞损伤有关。

文章解读链接：血液4D-DIA蛋白组项目文章NC（IF 17.69）| 西南医院柴进教授团队采用血液蛋白质组学等方法探究原发性胆管炎的致病靶点

影响因子：12.3

合作单位：中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心、上海交通大学医学院公共卫生学院

本研究旨在揭示小鼠MZT过程中的m⁶A修饰的动态变化，鉴定了少量参与着床前胚胎发育的m⁶A调控分子，初步阐明了Ythdc1可能参与母源继承m⁶A转录本的稳定性调控。主要结果：

① MZT期间m⁶A标记mRNA的动态图谱分析；

② m⁶A修饰功能分析：促进RNA衰变，亦可维持RNA稳定；

③ m⁶A修饰通过维持mRNA的稳定性调控MZT；

④ Ythdc1结合m⁶A修饰的mRNA并调控其稳定性。

文章解读链接：项目文章GB（IF18）| 4D-DIA蛋白组等多组学助力中科院脑智卓越中心揭示小鼠胚胎母源-合子转换过程中的RNA m6A动态

影响因子：11.3

合作单位：佛山市第一人民医院

本研究研究利用snRNA-seq及DIA蛋白质组学分析比较了I期和II期CC患者TME内的细胞异质性和功能，II期CC患者几乎所有免疫细胞的异质性都在很大程度上被调节，其表型明显具有免疫抑制作用。还发现了胶原蛋白的显著上调，可能被用作预后标志物。主要结果：

① 鉴定I期和II期宫颈癌的肿瘤细胞组成；

② CCI组与CCII组间的细胞组成差异及细胞群差异表达分析；

③ CCI和CCII组稍微DIA定量蛋白质组学显示CCII患者存在明显的免疫抑制。

文章解读链接：项目文章J Exp Clin Canc Res (IF 13) | 女神节特刊！DIA联合单细胞技术揭秘不同时期宫颈癌肿瘤微环境

以上只是几篇中科新生命DIA定量蛋白质组客户文献的简单分享文章，DIA定量蛋白质组技术的具有多种应用场景，具体为：

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