文献集免费下载 | 中科新生命2023年高分项目文章精选

01

# 01

文献名称：Gasdermin D licenses MHCII induction to maintain food tolerance in small intestine

发表期刊：Cell

影响因子：64.5

合作单位：中国科学技术大学

中科新生命提供的服务内容：蛋白质组

主要内容：该研究发现肠上皮细胞（IECs）积累了一个不易识别的GSDMD的13kD N端片段，该片段在响应膳食抗原时被caspase-3/7裂解。与30kD GSDMD裂解片段不同，IEC积累的GSDMD裂解片段易位到细胞核，诱导CIITA和MHCII分子的转录，进而诱导上小肠的Tr1细胞凋亡。用caspase-3/7抑制剂处理的小鼠、抗caspase-3/7裂解的GSDMD突变小鼠、IECs中MHCII缺乏的小鼠和Tr1缺乏的小鼠都表现出食物耐受表型的破坏。所以研究GSDMD的差异裂解可以作为控制小肠免疫与耐受的调节枢纽。

文章解读链接：项目文章Cell（IF 64.5）| 中国科技大学探索食物过敏谜团

# 02

文献名称：A de novo missense mutation in MPP2 confers an increased risk of Vogt–Koyanagi–Harada disease as shown by trio-based whole-exome sequencing

发表期刊：Cellular & Molecular Immunology

影响因子：24.1

合作单位：北京同仁医院/重庆医科大学附属第一医院

中科新生命提供的服务内容：TMT标记蛋白质组

主要内容：该研究团队利用TMT标记蛋白组学技术结合全外显子测序技术在VKH病患者中筛选到关键新发突变 MPP2-K315N (c.G945T, NM_001278372)，发现其通过直接结合ANXA2，促进ERK3/IL-17E通路激活，从而加剧炎症级联反应进而破坏屏障功能，最终导致VKH病的发生发展，该研究首次在国际上揭示了VKH病的新生突变MPP2-K315N，这为VKH病的发生新机制提供了新的见解，并有助于开发新的治疗靶点。

文章解读链接：项目文章Cell Mol Immunol（IF 24.1）| 重庆医科大学附属第一医院利用TMT标记蛋白组学探究VKH病机制

# 03

文献名称：The cell non-autonomous function of ID1 promotes AML progression via ANGPTL7 from the microenvironment

发表期刊：Blood

影响因子：20.3

合作单位：中科院上海营养与健康研究所

中科新生命提供的服务内容：TMT标记蛋白质组

主要内容：研究团队利用TMT标记蛋白组学技术结合qPCR和Western blot分析，发现ID1直接与RNF4相互作用，减弱SP1泛素化，并促进AML-MSCs中ANGPTL7的表达。更重要的是，ID1作为MSCs中调控白血病细胞非细胞自主性的关键转录调节因子，控制白血病的启动和进展，表明ID1作为AML治疗靶点的重要性，并有助于AML治疗策略的发展。

文章解读链接：项目文章Blood（IF 20.3）| 中科院上海营养与健康研究所利用TMT标记蛋白组学助力白血病机制研究

# 04

文献名称：A natural allele of proteasome maturation factor improves rice resistance to multiple pathogens

发表期刊：Nature Plants

影响因子：18.0

合作单位：四川农业大学

中科新生命提供的服务内容：标记定量蛋白质组

主要内容：该研究在雅恢2115中筛选到了一个编码蛋白酶体成熟因子的天然等位基因UMP1^R2115，该基因对多种病害具有广谱抗性对水稻产量没有影响。此外通过蛋白组学的机制解析发现了UMP1^R2115具有广谱抗性的通路，即活性26S蛋白酶体-POD和CAT降解-H₂O₂提高，从而增强水稻对多种病原菌的抵御能力。UMP1^R2115的发现为培育抗多种病害的高产水稻品种提供了新的基因资源。

文章解读链接：项目文章Nature Plants（IF 17.35）| 植物学顶刊！四川农业大学采用转录和蛋白组发现水稻广谱抗性、稳产新基因

# 05

文献名称：In situ generation of micrometer-sized tumor cell-derived vesicles as autologous cancer vaccines for boosting systemic immune responses

发表期刊：Nature Communications

影响因子：16.6

合作单位：东南大学

中科新生命提供的服务内容：蛋白质组

主要内容：研究团队制备了一系列纳米炸弹（Nanobombs，NBs），包括负载阿霉素（DOX，抗癌药物）和酪氨酸激酶抑制剂（TKI，抗癌药物）和透明质酸（HA，用于肿瘤靶向）包被的树枝状聚合物（Dendritic Polymers），称为HDDT NBs。该纳米炸弹具有~100%的将各种癌细胞转化为微米大小囊泡（HMVs）的能力。荷瘤小鼠模型证实HDDT NBs不但能够抑制肿瘤生长，并且能够通过原位生产HMVs将原发肿瘤转化为抗原库，作为癌症免疫治疗的个性化疫苗。

文章解读链接：项目文章Nat Commun | 东南大学研究团队开发“纳米炸弹”可杀伤肿瘤、并产生自体疫苗促进肿瘤免疫

# 06

文献名称：Unique DUOX2⁺ACE2⁺small cholangiocytes are pathogenic targets for primary biliary cholangitis

发表期刊：Nature Communications

影响因子：16.6

合作单位：西南医院

中科新生命提供的服务内容：血液4D-DIA蛋白质组

主要内容：该研究利用单细胞RNA测序、流式分选(FACS)等方法，在人和小鼠肝脏中鉴定了一种独特类型的DUOX2⁺ACE2⁺小胆管细胞。作者还通过血液蛋白质组学、qRCR等方法发现pIgR在DUOX2⁺ACE2⁺胆管细胞中高度表达。研究证实高表达pIgR抗原的DUOX2⁺ACE2⁺小胆管细胞是PBC的致病靶点。

文章解读链接：血液4D-DIA蛋白组项目文章NC（IF 17.69）| 西南医院柴进教授团队采用血液蛋白质组学等方法探究原发性胆管炎的致病靶点

# 07

文献名称：Using patient-derived organoids to predict locally advanced or metastatic lung cancer tumor response: A real-world study

发表期刊：Cell Reports Medicine

影响因子：14.3

合作单位：广东省人民医院

中科新生命提供的服务内容：4D-Labelfree蛋白质组

主要内容：该研究首次大规模收集晚期肺癌患者的浆膜腔积液（MSE）或肿瘤组织成功培养了162例类器官模型，并基于类器官的药物敏感性测试（LCO-DST）结果预测了LCOs临床疗效的准确性，且发现了LCOs具有预测联合治疗方案的巨大潜力。此外通过4D-Labelfree蛋白组学方式揭示了双靶向治疗明显触发细胞死亡的分子机制。

文章解读链接：4D-Labelfree项目文章（IF 17）| 广东省人民医院在肺癌类器官的临床转化研究领域实现重大突破

# 08

文献名称：Reading and writing of mRNA m⁶A modification orchestratematernal-to-zygotic transition in mice

发表期刊：Genome Biology

影响因子：12.3

合作单位：中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心/上海交通大学

中科新生命提供的服务内容：4D-DIA蛋白质组

主要内容：该研究利用SLIM-seq技术绘制出小鼠胚胎母源-合子转换过程中RNA m⁶A修饰动态图谱，并通过蛋白质组学分析和CRISPR/Cas13d介导基因敲低揭示m⁶A的读写对于小鼠着床前胚胎发育的影响。

文章解读链接：项目文章GB（IF18）| 4D-DIA蛋白组等多组学助力中科院脑智卓越中心揭示小鼠胚胎母源-合子转换过程中的RNA m6A动态

# 09

文献名称：Single-nucleus RNA sequencing and deep tissue proteomics reveal distinct tumour microenvironment in stage-I and II cervical cancer

发表期刊：Journal of Experimental & Clinical Cancer Research

影响因子：11.3

合作单位：佛山市第一人民医院

中科新生命提供的服务内容：DIA定量蛋白质组

主要内容：本研究通过使用snRNA-seq和DIA定量蛋白质组学，比较研究了I期和II期CC患者的TME。实验结果表明，II期CC患者几乎所有免疫细胞（包括MΦs、T细胞、B细胞、NK细胞和树突状细胞）的异质性都在很大程度上被调节，其表型明显具有免疫抑制作用。相比之下，这些细胞在I期CC患者中表现出增强的免疫反应，其中INF-α和γ反应是最激活的信号通路。此外，一些组蛋白显示出早期诊断CC的潜力。值得注意的是，对于II期CC患者，多种细胞类型的snRNA-seq分析和蛋白质组学分析分别鉴定出胶原蛋白的显著上调，提示它们可能被用作预后标志物。另外，本研究首次揭示了新型转录本AC244205.1的异常表达与II期CC的相关性。

文章解读链接：项目文章J Exp Clin Canc Res (IF 13) | 女神节特刊！DIA联合单细胞技术揭秘不同时期宫颈癌肿瘤微环境

# 10

文献名称：Ultrasound-excited temozolomide sonosensitization induces necroptosis in glioblastoma

发表期刊：Cancer Letters

影响因子：9.7

合作单位：天津市环湖医院

中科新生命提供的服务内容：4D Labelfree蛋白质组

主要内容：该研究首次发现TMZ在超声(US)的影响下会产生活性氧(ROS)。这一特性使得TMZ-US疗法在GBM治疗中具有更好的疗效。鉴于US在中枢神经系统(CNS)疾病中的使用日益增多，以及TMZ对GBM治疗的重要性，有助于TMZ对相关胶质母细胞瘤治疗的发展。

文章解读链接：Cancer Letters（IF 9.7）|天津市环湖医院利用Labelfree揭示超声-替莫唑胺联合诱导胶质瘤细胞的凋亡机制

# 11

文献名称：Arabidopsis SRPKII family proteins regulate flowering via phosphorylation of SR proteins and effects on gene expression and alternative splicing

发表期刊：New Phytologist

影响因子：9.4

合作单位：山东师范大学

中科新生命提供的服务内容：TMT磷酸化蛋白质组

主要内容：研究团队发现SPRKIIs调节特定SR蛋白的RS结构域磷酸化状态，介导其亚细胞定位和其他蛋白的结合。R45突变体通过抑制ASAP(凋亡剪接相关蛋白)复合物的组装，使表观遗传修饰FLC(Flowering Locus C)的表达上调。在srpkii突变体的茎尖，FLC内含子的剪接效率显著提高。转录组学分析显示，SRPKIIs调节了大约400个基因的选择性剪接，这些基因与SR45和SC35-SCL家族蛋白调节的基因大部分重叠。综上，拟南芥SRPKIIs特异性地影响SR蛋白亚类的磷酸化状态，调节FLC的表达和选择性剪接以控制开花时间。

文章解读链接：项目文章New Phytologist （IF 9.4）| 山东师范大学利用TMT磷酸化蛋白组学探究拟南芥开花机制

# 12

文献名称：Phylogeny, transcriptional profile, and auxin-induced phosphorylation modification characteristics of conserved PIN proteins in Moso bamboo (Phyllostachys edulis)

发表期刊：International Journal of Biological Macromolecules

影响因子：8.2

合作单位：国家林业和草原局北京竹藤科学技术重点实验室

中科新生命提供的服务内容：4D-Labelfree磷酸化修饰组

主要内容：该研究获得了毛竹中的PIN基因，并对起进行了理化、结构分析以及系统进化树分析。同时采用转录组揭示了PIN1亚家族的调控作用、采用4D-Labelfree磷酸化修饰组发现了PIN蛋白和蛋白激酶的磷酸化过程响应生长素的调节，并构建了一个以PIN蛋白为核心的植物激素相互作用网络。

文章解读链接：4D-Labelfree磷酸化项目文章（IF 8）| 国际竹藤研究中心采用4D磷酸化修饰组和转录组揭示毛竹生长素调控途径

02

# 01

文献名称：Light modulates glucose metabolism by a retina-hypothalamus-brown adipose tissue axis

发表期刊：Cell

影响因子：64.5

合作单位：中国科学技术大学

中科新生命提供的服务内容：非靶向代谢组

主要内容：该研究综合组学技术、大量神经环路示踪和操控手段、葡萄糖耐受性检测、肩胛间棕色脂肪组织（iBAT）温度检测等方法，深入在小鼠和人上揭示了光感知压抑棕色脂肪组织产热并诱发血糖不耐受的神经机制。

文章解读链接：项目文章Cell | 新年开门红！热烈祝贺中科大薛天教授团队发表重要研究成果-光调控代谢新机制

# 02

文献名称：The diapause-like colorectal cancer cells induced by SMC4 attenuation are characterized by low proliferation and chemotherapy insensitivity

发表期刊：Cell Metabolism

影响因子：29.0

合作单位：中国科学技术大学/郑州大学

中科新生命提供的服务内容：非靶向代谢组

主要内容：该研究利用转录组学、单细胞测序、非靶向代谢组学、代谢流分析等技术手段，发现染色体结构维持蛋白4 (SMC4)表达下调会诱导结直肠癌滞育样癌细胞（DLCC）呈现低增殖和对化疗不敏感的特点，为非遗传性化疗耐药机制提供了新的见解。

文章解读链接：项目文章Cell Metab（IF 29.0）| 中国科学技术大学揭示滞育样肿瘤细胞形成及调控机制

# 03

文献名称：Deficiency of gluconeogenic enzyme PCK1 promotes metabolic-associated fatty liver disease through PI3K/AKT/PDGF axis activation in male mice

发表期刊：Nature Communications

影响因子：16.6

合作单位：重庆医科大学附属第二医院

中科新生命提供的服务内容：非靶向代谢组

主要内容：该研究结合转录组学和代谢组学分析，发现PCK1缺乏通过激活RhoA/PI3K/AKT信号途径促进肝脏脂质沉积和纤维化，靶向AKT/RhoA通路的抑制剂可改善进行性纤维化，为MAFLD治疗提供潜在的治疗策略。

文章解读链接：项目文章Nat Commun（IF 17.69）| 重庆医科大学附属第二医院发现糖异生关键酶PCK1调控代谢相关脂肪肝的新机制

# 04

文献名称：ACSL4 Promotes Microglia-Mediated Neuroinflammation by Regulating Lipid Metabolism and VGLL4 expression

发表期刊：Brain, Behavior, and Immunity

影响因子：15.1

合作单位：青岛大学

中科新生命提供的服务内容：脂质组

主要内容：该研究结合转录组学、脂质组学、基因手段、免疫生化等实验研究发现LPS诱导后ACSL4的表达增加，敲低ACSL4会减少促炎细胞因子的产生，并结合体内和体外实验表明ACSL4是一种新型调节因子，通过调节退化样家族成员4（VGLL4）表达和脂质代谢来促进小胶质细胞介导的神经炎症。

文章解读链接：项目文章Brain Behav Immun (IF 19.227) |青岛大学崔玉课题组发现ACSL4促进神经炎症新机制

# 05

文献名称：ENO1 promotes liver carcinogenesis through YAP1-dependent arachidonic acid metabolism

发表期刊：Nature Chemical Biology

影响因子：14.8

合作单位：南方医科大学/中国科学技术大学

中科新生命提供的服务内容：靶向花生四烯酸代谢组

主要内容：该研究结合RIP-seq、转录组学和花生四烯酸靶向代谢组学分析，发现ENO1作为一种RNA结合蛋白可以通过YAP1/PLCB1/HPGD轴介导的花生四烯酸代谢促进肿瘤生长，阿司匹林治疗可以延缓肿瘤进展。ENO1介导的花生四烯酸代谢途径可能是肝癌患者的潜在治疗靶点。

文章解读链接：项目文章Nat Chem Biol（IF 14.8）| 南医大发现糖酵解酶ENO1通过YAP1依赖性花生四烯酸代谢调控肝癌发生

# 06

文献名称：Metabolic classification suggests the GLUT1/ALDOB/G6PD axis as a therapeutic target in chemotherapy-resistant pancreatic cancer

发表期刊：Cell Reports Medicine

影响因子：14.3

合作单位：中国科学院分子细胞科学卓越创新中心/中国科学院上海营养与健康研究所

中科新生命提供的服务内容：靶向能量代谢组

主要内容：该研究基于代谢组数据对PDAC类器官进行了新的分型，分为glucomet-PDAC(高糖代谢水平)和lipomet-PDAC(高脂代谢水平)，发现glucomet-PDACs比lipomet-PDACs对化疗的抵抗力更强，且患者的预后更差，确定了GLUT1/醛缩酶B（ALDOB）/葡萄糖-6-磷酸脱氢酶（G6PD）轴通过重塑葡萄糖代谢诱导化疗耐药性。

文章解读链接：项目文章 Cell子刊（IF 14.3）| 分子细胞卓越中心高栋及合作团队利用代谢分型发现化疗耐药胰腺癌治疗新靶点

# 07

文献名称：Gut microbiota alteration after cholecystectomy contributes to post-cholecystectomy diarrhea via bile acids stimulating colonic serotonin

发表期刊：Gut Microbes

影响因子：12.2

合作单位：复旦大学附属闵行医院

中科新生命提供的服务内容：靶向色氨酸代谢组

主要内容：该研究通过粪菌移植胆囊切除术后腹泻 （PCD）患者肠道菌群，确定菌群对腹泻的影响。随后通过菌群结构功能分析揭示了色氨酸代谢途径中血清素的重要作用，结合代谢组学发现菌群产生的次级胆汁酸可在体内外刺激血清素产生，并通过TGR5 / TRPA1信号通路介导，最终建立肠道菌群-粪便BAs代谢物-TGR5/TRPA1-血清素轴并明确其在PCD过程中的关键作用机制。

文章解读链接：项目文章Gut Microbes（IF 9.434）| 肠道微生物竟是导致胆囊切除术后患者腹泻的元凶？

# 08

文献名称：First insights into region-specific lipidome alterations of prefrontal cortex and hippocampus of mice exposed chronically to microcystins

发表期刊：Environment International

影响因子：11.8

合作单位：中国科学院水生生物研究所

中科新生命提供的服务内容：脂质组

主要内容：该文主要结合脂质组和基因表达谱研究了长期微囊藻毒素-LR(Microcystin-leucine arginine,MC-LR)暴露对小鼠前额叶皮层和海马的脂质组景观以及功能的影响，该研究揭示了脂质功能障碍在MCs的神经毒性中的作用机制。

文章解读链接：项目文章Environ Int（IF 11.8）|中科院水生所研究揭示微囊藻毒素长期暴露引起哺乳动物小鼠脑区特异性的脂质代谢变化

# 09

文献名称：TRIM21 attenuates renal carcinoma lipogenesis and malignancy by regulating SREBF1 protein stability

发表期刊：Journal Of Experimental & Clinical Cancer Research

影响因子：11.3

合作单位：徐州医科大学

中科新生命提供的服务内容：脂质组

主要内容：作者利用脂质组学和其它多种分子生物学方法揭示了TRIM21抑制RCC脂质代谢过程的新途径，并揭示了RCC靶向代谢治疗和预后诊断的发展。

文章解读链接：项目文章J Exp Clin Cancer Res（IF 12.6）|脂质组学助力解密TRIM21抑制RCC脂质代谢过程的新途径

# 10

文献名称：Distinct metabolic biomarkers to distinguish IgG4-related disease from Sjogren’s syndrome and pancreatic cancer and predict disease prognosis

发表期刊：BMC Medicine

影响因子：9.3

合作单位：中国医学科学院北京协和医院

中科新生命提供的服务内容：非靶向代谢组

主要内容：该研究首次利用代谢组学技术描绘了罕见病IgG4-RD的代谢特征谱，发现5种代谢物可以作为诊断IgG4-RD和其他易混淆疾病的潜在生物标志物。ABC转运蛋白、氨基酸代谢和糖酵解途径与其发病机制显著相关，为IgG4-RD治疗提供了新靶点。

文章解读链接：项目文章BMC Med（IF 9.3）| 北京协和医院利用代谢组学发现IgG4相关疾病新型标志物

# 11

文献名称：Activated malate circulation contributes to the manifestation of light-dependent mosaic symptoms

发表期刊：Cell Reports

影响因子：8.8

合作单位：中国农业大学

中科新生命提供的服务内容：靶向能量代谢组

主要内容：为揭示病毒感染导致花叶症状形成的机制，研究人员对SCMV侵染引起的玉米矮花叶病进行研究，发现在感染前期或感染期，SCMV感染通过降低光照下玉米叶片PPDK Thr527的磷酸化水平，提高PPDK的酶活性，导致苹果酸过量产生和随后的mROS积累。研究结果表明，激活的苹果酸循环有助于产生mROS，进而出现光依赖性花叶症状。

文章解读链接：项目文章Cell Reports （IF 8.8）| 中国农业大学利用转录组+代谢组揭示玉米矮花叶病花叶症状显现规律的分子机制

# 12

文献名称：Insight from untargeted metabolomics: Revealing the potential marker compounds changes in refrigerated pork based on random forests machine learning algorithm

发表期刊：Food Chemistry

影响因子：8.8

合作单位：中国农科院

中科新生命提供的服务内容：非靶向代谢组

主要内容：该文主要结合非靶向代谢组和随机森林机器学习算法分析了冷藏猪肉中的非挥发性化合物，发现D -木糖、黄嘌呤和丙酮醛可能是影响冷藏猪肉新鲜度的关键标志化合物，并创新性地提出了戊糖相关代谢在猪肉腐败中的关键作用。该研究提供了猪肉代谢产物的全面概况，并为识别猪肉中的生物标志物提供了新的思路，可用于肉类和肉制品的质量评价。

文章解读链接：项目文章Food Chem（IF 8.8）| 中国农科院团队结合非靶向代谢组和机器学习算法发现冷藏猪肉新鲜度变化的潜在标志物

# 13

文献名称：A classical herbal formula alleviates high-fat diet induced nonalcoholic steatohepatitis (NASH) via targeting mitophagy to rehabilitate dysfunctional mitochondria, validated by UPLC-HRMS identification combined with in vivo experiment

发表期刊：Biomedicine & Pharmacotherapy

影响因子：7.5

合作单位：深圳市中医院

中科新生命提供的服务内容：中药成分分析

主要内容：该研究利用成分组、网络药理学和实验验证等方法探讨了疏肝消脂方（Shugan Xiaozhi）在抗非酒精性脂肪性肝炎中的作用机制。

文章解读链接：项目文章 | 深圳市中医院童光东教授团队利用“成分-网药-实验验证”策略深入挖掘疏肝消脂方治疗非酒精性脂肪性肝炎的作用机制

# 14

文献名称：Integrated mass spectrometry imaging and single-cell tranome atlas strategies provide novel insights into taxoid biosynthesis and transport in Taxus mairei stems

发表期刊：The Plant Journal

影响因子：7.2

合作单位：杭州师范大学

中科新生命提供的服务内容：空间代谢组

主要内容：本研究以空间水平、单细胞水平的分辨率建立了红豆杉幼茎中代谢物及细胞类型的表达图谱，为进⼀步研究细胞特异的紫杉烷合成调控机制提供了基础。

文章解读链接：项目文章Plant J（IF 7）| 杭州师范大学王慧中团队通过空间代谢+单细胞测序等揭示红豆杉幼茎细胞特异的紫杉烷合成调控模式

03

# 01

文献名称：Ga-containing Ti alloy with improved osseointegration for bone regeneration: In vitro and in vivo studies

发表期刊：Composites Part B: Engineering

影响因子：13.1

合作单位：上海市第九人民医院

中科新生命提供的服务内容：转录组

主要内容：该研究旨在通过制备含镓钛合金来改善钛的骨整合，结果表明，镓促进了磷灰石的形成和骨髓间充质干细胞（BMSCs）的成骨分化，Ti - Ga合金的骨整合能力明显高于纯Ti，可延缓钛合金骨整合不足引起的种植体松动，具有潜在的临床应用价值。并利用转录组测序和Western blot探究验证Ga处理后，显著促进骨矿化、骨形态、骨化和骨重塑相关基因的表达，同时Kegg结果进一步证明镓可能通过Wnt信号通路和Hippo信号通路促进骨生成。

文章解读链接：项目文章Compos Part B-Eng（IF 11.322）｜上海第九人民医院杨盛兵团队发现新型“金属骨头”

# 02

文献名称：Regulatory Effects of Three-Dimensional Cultured Lipopolysaccharide-Pretreated Periodontal Ligament Stem Cell-Derived Secretome on Macrophages

发表期刊：International Journal of Molecular Sciences

影响因子：5.6

合作单位：天津医科大学

中科新生命提供的服务内容：多重细胞因子检测

主要内容：在该研究中，作者构建了PDLSC–SupraGel培养系统，并在LPS预处理经3D培养后收集牙周膜干细胞（PDLSCs）衍生的分泌组，以验证分泌组对巨噬细胞极化和迁移的调节作用。同时还利用多因子技术检测了分泌组中的免疫细胞因子的变化，以推测巨噬细胞的调节机制，试图为巨噬细胞调节牙周炎等炎症性疾病的无细胞治疗提供理论依据。

文章解读链接：项目文章INT J MOL SCI | 天津医科大学研究团队采用多重细胞因子检测技术助力3D细胞培养研究

04

# 01

文献名称：High dietary fructose promotes hepatocellular carcinoma progression by enhancing O-GlcNAcylation via microbiota-derived acetate

发表期刊：Cell Metabolism

影响因子：29.0

合作单位：重庆医科大学

中科新生命提供的服务内容：非靶向代谢组+O-糖基化修饰蛋白质组

主要内容：本研究在小鼠肝细胞癌模型中探索了高果糖促进肝癌进展的分子机制。结果显示，果糖的肠道微菌群衍生物——乙酸盐增强了肿瘤组织的O-GlcNAc糖基化，进而促进了肝癌进展。本研究为合理使用添加糖、防治代谢性疾病发生发展提供了重要的理论依据，并为相关疾病提供了潜在的治疗靶点。

文章解读链接：署名文章Cell Metabolism（IF 29）丨重庆医科大学利用代谢组和O-糖基化蛋白组揭示高果糖饮食促进肝癌进展的新机制

# 02

文献名称：IFI27 integrates succinate and fatty acid oxidation to promote adipocyte thermogenic adaption

发表期刊：Advanced Science

影响因子：15.1

合作单位：复旦大学

中科新生命提供的服务内容：蛋白质组+代谢组+脂质组

主要内容：该研究揭示了线粒体蛋白IFI27在维持正常嵴形态中发挥重要作用，它通过保持完整的琥珀酸脱氢酶功能以及活跃的脂肪酸氧化来促进棕色脂肪细胞的产热。

文章解读链接：项目文章Adv Sci（IF 15.1）| 复旦大学利用多组学助力解密IFI27调节线粒体代谢和适应性产热新机制

# 03

文献名称：Targeting phenylpyruvate restrains excessive NLRP3 inflammasome activation and pathological inflammation in diabetic wound healing

发表期刊：Cell Reports Medicine

影响因子：14.3

合作单位：中山大学

中科新生命提供的服务内容：非靶向代谢组+H650高通量靶向代谢组

主要内容：本研究发现苯丙酮酸通过CD36进入巨噬细胞，结合并抑制PPT1蛋白的酶活性，导致NLRP3蛋白棕榈酰化增加，增强NLRP3蛋白的稳定性，减少溶酶体的降解，促进NLRP3炎性小体的活化和炎症因子的释放，最终引发促炎巨噬细胞表型。本研究为糖尿病伤口过度炎症治疗提出了一种新的策略，为疾病临床治疗提供了新的思路。

文章解读链接：项目文章Cell Reports Medicine（IF14.3）| 非靶代谢组+H650发现防止糖尿病伤口过度炎症的新策略

# 04

文献名称：Multi-omics data reveals aberrant gut microbiota-host glycerophospholipid metabolism in association with neuroinflammation in APP/PS1 mice

发表期刊：Gut Microbes

影响因子：12.2

合作单位：上海交通大学医学院附属瑞金医院

中科新生命提供的服务内容：转录组学+16S rRNA测序+非靶向代谢组学+空间代谢组学

主要内容：该研究不仅利用16S rRNA基因测序和代谢组学探讨了AD小鼠肠道微生物丰度和血清代谢丰度的变化特征，还结合空间代谢组学、转录组学、神经影像学和病理学研究了大脑的变化并确定了它们间的相关性。该研究为阐明AD中微生物群-肠-脑轴的机制提供了更直接的证据。

文章解读链接：项目文章Gut Microbes（IF 12.2）| 瑞金医院利用多组学揭示肠道微生物群通过肠-脑轴影响阿尔茨海默病的分子机制

# 05

文献名称：Transcriptomics, proteomics, metabolomics and network pharmacology reveal molecular mechanisms of multi-targets effects of Shenxianshengmai improving human iPSC-CMs beating

发表期刊：Clinical and Translational Medicine

影响因子：10.6

合作单位：复旦大学中山医院/上海徐汇区中心医院

中科新生命提供的服务内容：转录组+蛋白质组+代谢组

主要内容：本文分享了中药药效功能机制研究的完整思路--首先通过中药成分分析确定活性成分，再网络药理学预测药物成分的作用靶点及通路，然后又基于转录组、蛋白组、代谢组进一步对预测的功能通路进行验证和补充，最终锁定关键的通路，即SXSM增加人源iPSC-CMs的细胞内钙循环和细胞内钙，并加速兴奋性收缩偶联，同时，SXSM通过充分调动糖酵解途径、氨基酸代谢和脂肪酸β-氧化来促进TCA循环和氧化磷酸化，从而更好地为人源iPSC-CMs供能。本研究可能为无法植入起搏器的心律失常患者提供替代治疗选择。

文章解读链接：项目文章Clin Transl Med（IF 10.6）| 成分组+网络药理学+多组学揭示参仙升脉改善人心肌细胞搏动的分子机制

# 06

文献名称：Methionine orchestrates the metabolism vulnerability in cisplatin resistant bladder cancer microenvironment

发表期刊：Cell Death and Disease

影响因子：9.0

合作单位：复旦大学附属华山医院

中科新生命提供的服务内容：4D-Labelfree蛋白质组+代谢组

主要内容：本研究介绍了甲硫氨酸在顺铂膀胱癌微环境中的主导作用。通过抑制MAT2A或限制甲硫氨酸来下调甲硫氨酸通量与抑制SLC家族SLC7A6的联合治疗，可以破坏癌细胞中甲硫氨酸的高消耗并保留CD8+T细胞的功能，这对于顺铂耐药的膀胱癌细胞患者是一个很有前景的临床治疗选择。

文章解读链接：项目文章Cell Death and Disease（IF 9.0）| 华山医院利用蛋白组学代谢组学联合分析揭示膀胱癌顺铂耐药性

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