JAMA(IF 120.7)最新重磅:突破血液蛋白组极限,发现全新风险预测标志物
研究概述
近期,国际顶尖临床期刊美国医学会会刊JAMA主刊(IF 120.7)在线发表了创新研究成果“Evaluation of Large-Scale Proteomics for Prediction of Cardiovascular Events”。该研究基于Somascan平台对5000种血液蛋白进行了分析,建立了用于ASCVD(动脉粥样硬化性心血管疾病)风险预测的蛋白质风险评分,并将其与原发性和继发性事件人群的临床危险因素和多基因风险评分进行比较,研究表明蛋白质风险评分在预测心血管事件风险方面具有巨大的潜力,这为之后ASCVD风险预测血液蛋白标志物的临床转化提供了新的思路。
研究队列及相关技术
研究路线与结果
发现队列(原发)
队列规模:13540例;
蛋白检测平台:Somascan
验证队列(继发)
队列规模:6791例;
蛋白检测平台:Somascan
拓展解读:突破血液蛋白组的检测极限
相较于组织细胞类样本,血液的蛋白组的动态范围跨度更大,可达10~12数量级。
这对蛋白质组检测来说是巨大的挑战,意味着不仅需要检测到低丰度的蛋白,还需要对高、低丰度蛋白都能准确地定量。目前主流的血液蛋白质组技术比较如下:
技术 |
血液蛋白最高鉴定数量 |
准确性 |
稳定性 |
Somascan |
11K |
★★★★ |
★★★★ |
Olink |
5K |
★★★★ |
★★★★ |
新一代质谱+磁珠富集 |
6K |
★★★ |
★★★ |
从表格可以看出,Somascan平台具有整体优势,尤其是在保证准确性和稳定性的基础上,具有显著的深度覆盖优势。该研究中使用了Somascan-5K kit,经过不断优化,如今平台已经升级至11K kit,可检测蛋白数量已翻倍至11000种。除此之外,Somascan已经在众多方向被广泛应用。
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