单细胞测序
2023-09-13
中科新生命
1201单细胞测序 •单细胞转录组测序(10Xgenomics)
· 产品定义
10Xgenomics单细胞转录组测序通过微流控分选单个细胞，然后通过带有barcode和引物的磁珠与细胞结合，被油滴包裹形成油包水结构，实现了对大量细胞的快速高效标记、测序和分析，获得单细胞水平转录表达信息，并依据特征基因的表达对不同细胞群进行鉴定和注释，实现样本、细胞群之间的差异分析、细胞演化过程以及细胞与细胞间的相互作用等分析内容，从而获得高分辨率的细胞图谱。
· 技术路线
· 平台优势
1. 完备的细胞捕获平台（Chromium Controller仪器和Chromium X Series仪器）；
2. 丰富的样本处理经验（如人/鼠等多个物种的脑/心脏/肝/肺/脾/肾/肠/胃等多种器官组织样本）；
3. 高标准实验环境，进口试剂耗材，最大限度消除各种不良因素影响，保障建库质量；
4. 强大的生信团队，可根据客户需求提供标准化、个性化的数据分析解决方案。
· 数据分析
· 部分数据分析结果展示
· 推荐应用领域
1. 细胞图谱的构建
2. 细胞异质性及组织微环境研究
3. 免疫调控研究
4. 神经分化发育研究
5. 疾病机制研究
6. 药物动力学研究
· 样本要求（特殊样本可直接咨询021-5466-5263/400-06606761）
1. 样品总量：制备成细胞悬浮液，一个样本的细胞起始量需大于1×10 5个；
2. 样品浓度：最终上样捕获前细胞浓度在700 - 1,200 cells / μL；
3. 细胞活性：活细胞数目在85 %以上；
4. 细胞大小：直径小于40 μm；
5. 细胞培养基及缓冲液不能含有Ca 2+和Mg 2+等影响酶活性的物质；
6. 血液样本需要用EDTA抗凝管收集，不能采用含有肝素的抗凝管；
7. 植物样本需制备成原生质体。
· 推荐组合产品
1. 单细胞转录组+bulk RNA-seq/蛋白组学；
2. 单细胞转录组+空间组学（空间转录组/空间代谢组）；
3. 单细胞转录组+16s/宏基因组+代谢组；
4. 单细胞转录组+基因组（WES/WGS）。
· 参考文献
1.Shengqian Dou,et al,Molecular identity of human limbal heterogeneity involved in corneal homeostasis and privilege.Ocular Surface.2021.DOI:10.1016/j.jtos.2021.04.010.
2.Li SB,et al.Hyperexcitable arousal circuits drive sleep instability during aging.Science.2022.doi: 10.1126/science.abh3021.
3.Andrew C. Yang,et al.A human brain vascular atlas reveals diverse mediators of Alzheimer’s risk.Nature.2022.DOI: 10.1038/s41586-021-04369-3.
单细胞测序 •10Xgenomics单细胞免疫组库
· 产品定义
10Xgenomics 单细胞免疫组库利用5'端接头的通用引物和免疫分子恒定区的巢式引物进行T细胞和B细胞的V(D)J富集，从而实现高通量的单细胞免疫组库测序和成对的重链和轻链（B细胞）或α和β链（T细胞）的全长测序。为免疫组库全面、系统的研究提供了高效的技术平台，对疾病发生、发展的分子机制研究有重要的意义。
· 技术路线
· 平台优势
1. 完备的细胞捕获平台（Chromium Controller仪器和Chromium X Series仪器）；
2. 丰富的样本处理经验（如人/鼠等多个物种的脑/心脏/肝/肺/脾/肾/肠/胃等多种器官组织样本）；
3. 高标准实验环境，进口试剂耗材，最大限度消除各种不良因素影响，保障建库质量；
4. 强大的生信团队，可根据客户需求提供标准化、个性化的数据分析解决方案。
· 数据分析
· 部分数据分析结果展示
· 推荐应用领域
1. 肿瘤免疫
2. 感染性疾病
3. 抗体研究
4. 疫苗研发
5. 自身免疫性疾病
6. 器官移植
7. 免疫系统发育
· 样本要求（特殊样本可直接咨询021-5466-5263/400-066-6761）
1. 样品总量：制备成细胞悬浮液，一个样本的细胞起始量需大于1×10 5个；
2. 样品浓度：最终上样捕获前细胞浓度在700 - 1,200 cells / μL；
3. 细胞活性：活细胞数目在85 %以上；
4. 细胞大小：直径小于40 μm；
5. 细胞培养基及缓冲液不能含有Ca 2+和Mg 2+等影响酶活性的物质；
6. 血液样本需要用EDTA抗凝管收集，不能采用含有肝素的抗凝管。
· 参考文献
1.Su Y,et al. Multi-Omics Resolves a Sharp Disease-State Shift between Mild and Moderate COVID-19. Cell.2020. DOI: 10.1016/j.cell.2020.10.037.
2.Jing L,et al.KIR + CD8 + T cells suppress pathogenic T cells and are active in autoimmune diseases and COVID-19.Science. 2022. doi: 10.1126/science.abi9591.
3.Yedan Liu,et al.Immune phenotypic linkage between colorectal cancer and liver metastasis.Cancer Cell. 2022. doi: 10.1016/j.ccell.2022.02.013.
