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靶向蛋白质组

2023-09-13
中科新生命
823

靶向蛋白质组 •PRM蛋白质组学

· 产品定义

PRM蛋白质组学(平行反应监测, parallel reaction monitoring)是一种基于LC-MS/MS的靶向蛋白质分析技术,能够对目标蛋白、目标肽段(包括发生翻译后修饰的肽段)进行高选择性、高特异性、高重复性和高准确性检测,从而实现对目标蛋白/肽段的相对或绝对定量分析。

PRM技术分析原理

PRM技术分析原理  

 

· 技术路线

技术路线

 

· 技术优势

1. 适用性广:无物种限制;通量高:可一次性检测多达100个目标蛋白质,节省样本集实验成本;

2. 定量能力强:灵敏度可达ppm级别,线性范围可达5-6个数量级;特异性高:可精细区分亚型、修饰位点

3. 突变位点等精细序列差异;克服标记定量技术在样本数量的上限制,灵活方便。

 

· 数据分析

标准数据分析

 

· 推荐组合产品

蛋白组+PRM/PRM plus

 

· 推荐应用领域

1. 蛋白质组结果验证

2. 对目标蛋白质/肽段进行相对或者绝对定量检测

3. 疾病标志物靶向检测

4. 靶向药物的开发

5. 生物通路特定信号研究

 

· 送样建议(特殊样本可直接咨询021-5466-5263/400-066-6761)

样品类型

推荐样本量

动物组织类

常规动物组织(脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉、皮肤等)

15mg-2g

植物组织类

柔软组织(木本植物的叶、花等,草本科植物,藻类,蕨类植物,大型真菌等)

50mg-2g

微生物类

菌类

20mg-2g

细胞样品

悬浮/贴壁培养细胞

0.5-10× 10^7

体液样本

血清/血浆

0.05ml-1ml

外泌体

提取完成的外泌体

>15-50μg 

血浆(未提取外泌体)

2ml(超速离心法)

600μlEvtrap磁珠法)

其他类

细胞上清

5ml-10ml

 

· 参考文献

1. KIF5A-dependent axonal transport deficiency disrupts autophagic flux in trimethyltin chlorideinduced neurotoxicity. 2020. Autophagy. (IF 16.016) 【客户文献】

利用蛋白质组学和PRM探索了三甲基氯化锡(TMT)引起神经毒性的分子机制

2. Large-scale proteomic analysis of Alzheimer's disease brain and cerebrospinal fluid reveals early changes in energy metabolism associated with microglia and astrocyte activation. Nat Med. 2020.

TMT蛋白质组+PRM靶向验证-人脑组织+脑脊液-通过对大规模群体进行蛋白质组学检测,并采用WGCNA分析挖掘AD关键蛋白模块(包括能量代谢),揭示能量代谢紊乱对阿尔茨海默病早期功能障碍的重要影响

3.Circulating proteomic panels for diagnosis and risk stratification of acute-on-chronic liver failure in patients with viral hepatitis B. Theranostics. 2019.

蛋白质组学+PRM靶向蛋白组学-人血浆-通过“筛选-验证”的思路,挖掘了大量HBV-ACLF相关候选标志物,开发了慢加急性肝衰竭ACLF临床治疗中诊断及预后血浆蛋白标志物组合的研究

4.Mutations in RABL3 alter KRAS prenylation and are associated with hereditary pancreatic cancer. Nat Genet. 2019.

PRM靶向蛋白组学-斑马鱼胰腺\肝脏-确定了RABL3突变作为癌症家族基因检测的靶点,并揭示了在发育和癌症中RAS活性失调的机制

 

靶向蛋白质组 •Olink靶向蛋白质组学

 

· 产品定义

Olink靶向蛋白质组学是基于PEA技术(Proximity Extension Assay,PEA)的靶向高敏微量体液蛋白质组学,通过抗体对目标蛋白特异性识别、结合抗体末端寡核苷酸序列的扩增,实现对疾病与生理过程中血清、血浆等各类体液样本中目标蛋白的定量分析。

 

· 技术路线

技术路线

 

· 技术优势

1. 高特异性:PEA专利技术,双抗体识别有效降低假阳性

2. 高灵敏度:检测浓度阈值低至fg、pg/ml

3. 高通量:同时实现96~3072种目标蛋白质检测

4. 样本友好:上样量低至1~8 ul,适用于血清、血浆等多种人体液样本

 

· 数据分析

 数据分析

 

· 推荐应用领域

1. 疾病生物标志物筛选;

2. 新药研发,药效筛选。

3. 单细胞系统多组学分析

4. 肠道微生物研究

 

· 送样建议(特殊样本可直接咨询021-5466-5263/400-066-6761)

送样建议

 

· 参考文献

1. In-depth plasma proteomics reveals increase in circulating PD-1 during anti-PD-1 immunotherapy in patients with metastatic cutaneous melanoma. 2020, JITC(IF 13.7)

肿瘤免疫:OLINK蛋白组+质谱蛋白组,全面覆盖血液高低丰度蛋白,寻找与免疫抑制剂治疗结果相关的潜在生物标志物

2. Gut-microbiota-targeted diets modulate human immune status. 2021. Cell. (IF 41.58)

OLINK蛋白组+微生物多样性:发现肠道微生物群靶向的饮食能够调节人体免疫状态