靶向蛋白质组
靶向蛋白质组 •PRM蛋白质组学
· 产品定义
PRM蛋白质组学(平行反应监测, parallel reaction monitoring)是一种基于LC-MS/MS的靶向蛋白质分析技术,能够对目标蛋白、目标肽段(包括发生翻译后修饰的肽段)进行高选择性、高特异性、高重复性和高准确性检测,从而实现对目标蛋白/肽段的相对或绝对定量分析。
PRM技术分析原理
· 技术路线
· 技术优势
1. 适用性广:无物种限制;通量高:可一次性检测多达100个目标蛋白质,节省样本集实验成本;
2. 定量能力强:灵敏度可达ppm级别,线性范围可达5-6个数量级;特异性高:可精细区分亚型、修饰位点
3. 突变位点等精细序列差异;克服标记定量技术在样本数量的上限制,灵活方便。
· 数据分析
· 推荐组合产品
蛋白组+PRM/PRM plus
· 推荐应用领域
1. 蛋白质组结果验证
2. 对目标蛋白质/肽段进行相对或者绝对定量检测
3. 疾病标志物靶向检测
4. 靶向药物的开发
5. 生物通路特定信号研究
· 送样建议(特殊样本可直接咨询021-5466-5263/400-066-6761)
样品类型 |
推荐样本量 |
|
动物组织类 |
常规动物组织(脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉、皮肤等) |
15mg-2g |
植物组织类 |
柔软组织(木本植物的叶、花等,草本科植物,藻类,蕨类植物,大型真菌等) |
50mg-2g |
微生物类 |
菌类 |
20mg-2g |
细胞样品 |
悬浮/贴壁培养细胞 |
0.5-10× 10^7 |
体液样本 |
血清/血浆 |
0.05ml-1ml |
外泌体 |
提取完成的外泌体 |
>15-50μg |
血浆(未提取外泌体) |
2ml(超速离心法) 600μl(Evtrap磁珠法) |
|
其他类 |
细胞上清 |
5ml-10ml |
· 参考文献
1. KIF5A-dependent axonal transport deficiency disrupts autophagic flux in trimethyltin chlorideinduced neurotoxicity. 2020. Autophagy. (IF 16.016) 【客户文献】
利用蛋白质组学和PRM探索了三甲基氯化锡(TMT)引起神经毒性的分子机制
2. Large-scale proteomic analysis of Alzheimer's disease brain and cerebrospinal fluid reveals early changes in energy metabolism associated with microglia and astrocyte activation. Nat Med. 2020.
TMT蛋白质组+PRM靶向验证-人脑组织+脑脊液-通过对大规模群体进行蛋白质组学检测,并采用WGCNA分析挖掘AD关键蛋白模块(包括能量代谢),揭示能量代谢紊乱对阿尔茨海默病早期功能障碍的重要影响
3.Circulating proteomic panels for diagnosis and risk stratification of acute-on-chronic liver failure in patients with viral hepatitis B. Theranostics. 2019.
蛋白质组学+PRM靶向蛋白组学-人血浆-通过“筛选-验证”的思路,挖掘了大量HBV-ACLF相关候选标志物,开发了慢加急性肝衰竭ACLF临床治疗中诊断及预后血浆蛋白标志物组合的研究
4.Mutations in RABL3 alter KRAS prenylation and are associated with hereditary pancreatic cancer. Nat Genet. 2019.
PRM靶向蛋白组学-斑马鱼胰腺\肝脏-确定了RABL3突变作为癌症家族基因检测的靶点,并揭示了在发育和癌症中RAS活性失调的机制
靶向蛋白质组 •Olink靶向蛋白质组学
· 产品定义
Olink靶向蛋白质组学是基于PEA技术(Proximity Extension Assay,PEA)的靶向高敏微量体液蛋白质组学,通过抗体对目标蛋白特异性识别、结合抗体末端寡核苷酸序列的扩增,实现对疾病与生理过程中血清、血浆等各类体液样本中目标蛋白的定量分析。
· 技术路线
· 技术优势
1. 高特异性:PEA专利技术,双抗体识别有效降低假阳性
2. 高灵敏度:检测浓度阈值低至fg、pg/ml
3. 高通量:同时实现96~3072种目标蛋白质检测
4. 样本友好:上样量低至1~8 ul,适用于血清、血浆等多种人体液样本
· 数据分析
· 推荐应用领域
1. 疾病生物标志物筛选;
2. 新药研发,药效筛选。
3. 单细胞系统多组学分析
4. 肠道微生物研究
· 送样建议(特殊样本可直接咨询021-5466-5263/400-066-6761)
· 参考文献
1. In-depth plasma proteomics reveals increase in circulating PD-1 during anti-PD-1 immunotherapy in patients with metastatic cutaneous melanoma. 2020, JITC(IF 13.7)
肿瘤免疫:OLINK蛋白组+质谱蛋白组,全面覆盖血液高低丰度蛋白,寻找与免疫抑制剂治疗结果相关的潜在生物标志物
2. Gut-microbiota-targeted diets modulate human immune status. 2021. Cell. (IF 41.58)
OLINK蛋白组+微生物多样性:发现肠道微生物群靶向的饮食能够调节人体免疫状态