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Cancer Cell | 不容错过的糖代谢高分文章!李贵登团队揭示甘露糖增强T细胞干性,增强抗肿瘤能力

2024-12-17
中科新生命
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在肿瘤微环境 (TME) 中或者在慢性病毒感染期间,CD8+T 细胞经常经历走向衰竭的分化轨迹,这对基于T细胞的各类免疫疗法的起效构成了巨大的挑战。在这其中,甘露糖代谢减少是T细胞功能障碍的一个关键特征。2024年12月,中国医学科学院苏州系统医学研究所李贵登、美国华盛顿大学Philip D. Greenberg共同通讯在Cancer Cell(IF=48.8)发表题为“Mannose metabolism reshapes T cell differentiation to enhance anti-tumor immunity”的研究论文,发现通过补充 D-甘露糖在过继转移的T细胞中诱导代谢重编程并增加O-GlcNAc转移酶 (OGT) 介导的β-catenin O-GlcNAc糖基化,从而保留 Tcf7 表达和表观遗传干性,并限制体外和体内的耗竭分化。



 

 

 

 研究材料

黑色素瘤小鼠模型、小鼠来源的原代T细胞、多种肿瘤细胞系

 

 

 技术方法

转录组、单细胞转录组、非靶代谢组、代谢流、CUT&Tag-seq等

 

 

 技术路线

步骤1:确认T细胞甘露糖代谢紊乱与耗竭呈正相关

步骤2:增强甘露糖代谢能够减缓T细胞耗竭并提高体内抗肿瘤功能

步骤3:D-甘露糖处理可体外促进T细胞呈现干细胞样表型

步骤4:D-甘露糖介导T细胞代谢重编程并维持表观遗传干性

步骤5:D-甘露糖处理驱动β-连环蛋白的O-GlcNAc糖基化并维持其在T细胞中的稳定性

步骤6:D-甘露糖升高型的T细胞表现出更强的体内抗肿瘤功效

步骤7:D-甘露糖使耗竭分化与长期扩增脱钩,在体外产生干细胞样T细胞产物

 

 

 研究结果

1. T细胞甘露糖代谢紊乱与耗竭呈正相关

利用已经公开发表的人类癌症的肿瘤浸润 T 细胞 (TIL) 和小鼠肿瘤、淋巴细胞脉络丛脑膜炎病毒 (LCMV) 慢性感染的耗尽 T 细胞的scRNA-seq 数据集分析 TIL 的异质代谢景观,观察到了与耗竭相关的代谢途径的高度富集,其中就包括果糖/甘露糖代谢。随后构建甘露糖磷酸异构酶 (Mpi) 缺失的小鼠模型,发现缺失Mpi会促进耗竭亚群的产生并抑制T细胞中细胞因子的产生,表明Mpi缺失导致的甘露糖代谢紊乱会促进T细胞耗竭。

图1 甘露糖代谢紊乱与T细胞耗竭呈正相关

 

2. 增强甘露糖代谢能够减缓T细胞耗竭并提高体内抗肿瘤功能

对接受过继T细胞疗法(ACT)的B16-OVA 小鼠口服 D-甘露糖,发现补充D-甘露糖改善了肿瘤控制,并增加了肿瘤内OT-I T细胞的百分比和数量,这些 T 细胞表现出较高的TCF1表达和较低的CD39 表达,并且 IFN-γ+和 TCF1+IM-3-Tpex细胞的频率增加。这表明补充D-甘露糖可限制T细胞的耗竭分化并增强体内抗肿瘤免疫。进一步地,对这些OT-I TIL进行单细胞转录联合表面蛋白测序 (CITE-seq),发现口服甘露糖处理组中表达干性与增殖相关基因/蛋白的cluster占比更高,且甘露糖代谢、核苷酸代谢、氧化磷酸化和胆固醇生物合成等代谢途径也被激活。而未口服甘露糖组中则是以表达耗竭相关基因的cluster为主。因此,通过口服D-甘露糖恢复甘露糖代谢可增强肿瘤特异性TIL的干性和增殖潜力,并减少耗竭。

图2 补充甘露糖能够缓解耗竭并增强抗肿瘤能力

 

3. D-甘露糖处理可体外促进T细胞呈现干细胞样表型

对小鼠来源的原代T细胞体外补充D-甘露糖显著增加CD44+CD62L+TCM(中央记忆)细胞的百分比和总数以及TCF1表达,且与剂量呈正相关。此外,D-甘露糖处理后细胞高表达Sca-1(干细胞抗原1,细胞干性的另一个标志物),表明T细胞获得了干细胞样T细胞表型。通过TCR激活重新刺激这些细胞来检查这些细胞的增殖能力,D-甘露糖处理的 T 细胞在重复刺激后表现出更优越的生存优势。转录组测序结果表明,D-甘露糖处理导致T细胞干性样表型基因(例如Ccr7Sell)显著增加,效应基因(例如GzmbIfngPrf1Tbx21)减少。而D-甘露糖培养的人源T细胞表现出更高比例的干细胞样群体,这些结果都表明D-甘露糖在体外有效诱导干细胞样T细胞的分化。

图3 D-甘露糖处理在体外促进干细胞样T细胞的分化

 

4. D-甘露糖介导T细胞代谢重编程并维持表观遗传干性

转录组数据中还发现D-甘露糖处理会破坏肿瘤细胞的细胞内糖酵解。据此,进行非靶代谢检测,D-甘露糖处理增加了T细胞内糖酵解和三羧酸循环中中间代谢产物的丰度。针对糖酵解与TCA循环进行代谢流分析,观察到D-甘露糖处理确实阻碍了[13C6]-葡萄糖进入糖酵解中间体,同时增强了其进入TCA循环,即发生了糖酵解的抑制以及替代碳源利用的激活。因此,使用 [13C5] 标记的谷氨酰胺和 [13C16]标记的棕榈酸酯在 T 细胞中进行示踪实验,发现D-甘露糖治疗可能会使T细胞转向利用谷氨酰胺进行还原羧化,而不是进入 TCA 循环进行氧化代谢。

鉴于D-甘露糖处理显著增加了 T 细胞中α-KG 的丰度(一种调节 DNA 和组蛋白甲基化的关键代谢物),进行了CUT&Tag-seq,D-甘露糖处理下H3K4me3与Tpex/初始T细胞状态相关的转录因子(例如 TCF7 和 LEF1)的结合motif富集,而D-甘露糖处理下与细胞分化相关的基因位点上H3K27me3的富集增加。

图4 D -甘露糖介导T细胞代谢重编程并维持表观遗传干性

 

5. D-甘露糖处理驱动β-连环蛋白的O-GlcNAc糖基化并维持其在T细胞中的稳定性

非靶代谢的数据中发现D-甘露糖处理导致HBP途径相关的细胞内代谢物发生显著变化,该途径的中间代谢产物UDP-GlcNAc是经典的O-GlcNAc 糖基化的供体,因此进行糖基化水平检测,观察到D-甘露糖处理显著增加了人和鼠 T细胞中O-GlcNAc糖基化蛋白的总水平。其中β-catenin 是一种与Tcf7/Lef1表达相关的转录调节因子,与干性样分化促进有关。此外,放线菌酮 (CHX) 追踪分析表明,D-甘露糖的存在延长了内源性 β-连环蛋白的半衰期。另外,O-GlcNAc糖基转移酶(OGT)特异性抑制剂OSMI-1的使用能够减轻并抑制D-甘露糖诱导的β-连环蛋白糖基化以及Wnt信号传导,抑制干性样表型,而过表达OGT则增加干性样亚群。因此,D-甘露糖通过 OGT 激活 Wnt/β-catenin信号通路,从而增强β-catenin O-GlcNAc糖基化和稳定性,从而增加TCF1的表达并促进T细胞中的干细胞样表型。

图5 D-甘露糖处理驱动OGT介导的β-连环蛋白O-GlcNAc糖基化,并维持其在T细胞中的稳定性

 

6. D-甘露糖升高型的T细胞表现出更强的体内抗肿瘤功效

利用有或没有D-甘露糖的情况下体外激活和培养的OVA特异性T细胞构建B16-OVA 黑色素瘤的ACT模型,以验证其抗肿瘤功效,观察到D-甘露糖组肿瘤生长的抑制增强,肿瘤部位、血液、TDLN 和脾脏中转移的OT-I T细胞的百分比和数量升高。对OT-I T细胞的转录组测序表明耗竭相关的基因表达减少。

另外采用K562-CD19异种移植模型评估了D-甘露糖扩增的CD19 CAR-T细胞的抗肿瘤能力,同样观察到D-甘露糖处理增强了肿瘤控制。

图6  D-甘露糖升高的T细胞在体内表现出增强的抗肿瘤作用

 

7. D-甘露糖使耗竭分化与长期扩增脱钩,在体外产生干细胞样T细胞产物

使用含有重组人IL-2的对照或D-甘露糖补充培养基进行长时间体外扩增,D-甘露糖处理组CD45RO-CD27+干细胞样CD8+T细胞亚群的百分比和数量更高,且TCF1表达升高。对长期培养12/36天的细胞分别进行转录组测序,36天的甘露糖组T细胞仍然表达较高水平的干细胞样基因和较低水平的耗竭相关分子,以及类似于记忆 T 细胞的表达特征,表明D-甘露糖处理可以支持T细胞的长期扩增,并在体外保留细胞干性。在异种移植小鼠模型中分别验证其抗肿瘤能力,D-甘露糖处理组也表现出更优的治疗能力。

图7  D-甘露糖处理在体外产生干细胞样T细胞产物

 

 

小编小结

克服T细胞功能障碍,包括代谢障碍,如葡萄糖、氨基酸和脂肪酸代谢等导致的过继T细胞疗法疗效受损是当前的一大重要挑战。该研究发现补充D-甘露糖促进能够OGT 介导的β-连环蛋白 O-GlcNAc修饰和稳定性,从而增强T细胞干性,因此,通过补充 D-甘露糖增强 T 细胞中的甘露糖代谢,可增强抗肿瘤活性、限制耗竭分化并维持T细胞干性,这为未来开发更高效、持久且经济的T细胞疗法提供了全新的解决方案。

 

 

 

 

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