中药单体 | 6篇经典高分文章案例,揭示中药研究中如何高效鉴定活性药物靶点
PART 01
技术原理
◆ Technical Principles ◆
Lip-MS技术最初由瑞士苏黎世联邦理工学院的Paola Picotti课题组建立,利用小分子结合蛋白后相较于原蛋白产生蛋白质空间构象和位阻的变化,经蛋白酶切后形成差异肽段,通过质谱分析识别和鉴定差异肽段,基于差异肽段推测蛋白质与小分子的相互作用区域。
PART 02
技术优势
◆ Technical advantages ◆
PART 03
技术流程
◆ Technical process ◆
在非变性条件下提取蛋白,以保留蛋白活性和空间结构。先使用蛋白酶K对蛋白-小分子复合物进行有限的蛋白酶切。蛋白与小分子结合后,蛋白构象发生变化,会暴露出不同的广谱性蛋白酶酶切位点,产生不同的蛋白酶切片段。蛋白酶K酶切后再将蛋白样品变性,用胰酶进行二次酶切,通过质谱检测识别和鉴定差异肽段,基于差异肽段所处位置预测蛋白质与小分子的相互作用区域。
Trends Biochem Sci. 2020 Oct;45(10):919-920.
PART 04
应用实例
◆ Application cases ◆
目前,Lip-MS技术正以其独特的优势越来越受到高水平文章的青睐,在此分享6篇Lip-MS经典案例以供参考:
案例1
案例2
案例3
案例4
案例5
案例6
PART 05
总结
◆ Conclusion ◆
活性单体是新药创制的重要源泉,其研究的重点、难点在于寻找其直接作用的靶点。探针法是直接作用靶点鉴定的主要方法之一,该方法将药物制作成探针并固定在载体上,然后钓取与其结合的蛋白并进行鉴定。但是,探针法受到化学合成实验条件以及药物结构性质等方面的限制,其适用范围有限。一些新的化学蛋白质组方法,如有限酶切法(Lip-MS),可通过分析蛋白的酶切状态,是否因被药物结合而发生改变,实现对结合蛋白的大规模鉴定。这类方法无需将药物制备成探针,而且还可能提供结合区域序列的精细信息。
PART 06
中科Lip-MS项目经验
◆ Conclusion ◆
中科新生命在Lip-MS实验上有着丰富的项目经验,目前与各大中医药院所有着广泛的合作,已开展Lip-MS服务3年。
小分子类型涵盖中药单体、天然产物、合成药物、内源性代谢物等。
样本类型:细胞、细菌、真菌、组织、蛋白裂解液。
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