“引爆”科研界 | 空间多组学重磅来袭
2023-08-31
中科新生命
2991重 磅 来 袭 ！
空间多组学
· 领先的空间多组学平台
· 超高性价比,项目经验丰富
· 提供“—站式”解决方案
优惠价：3.8万元起
2022年，《Nature》杂志将空间组学（Spatial Omics）技术列为最值得关注的七大技术之一，其有可能彻底改变我们对复杂组织微环境和动态生物过程的理解。尽管近年来出现了各种空间组学技术，但在充分发挥其潜力之前，仍需要解决几个艰巨的挑战，其中空间不同组学间的数据整合是一项重大挑战。尽管困难重重，空间组学技术仍以惊人的速度快速发展，相关文章呈爆发式增长，现在已然来到了黄金时期。
2023空间多组学
2020空间转录组
重
磅
喜
讯
中科新生命技术团队潜心研究，打通了空间多组学从实验端到分析端的技术屏障，开发高端对齐整合算法，解决数据整合难题，可以通过对同一份样本连续切片，实现对相邻切片进行空间转录组、空间蛋白质组、空间代谢组数据的联合分析。帮助老师们从系统生物学维度，结合不同层面的生物学信息，多维度的对生物学规律进行系统解释，实现从空间维度进行表型→机制的全面揭示。
技 术 路 线
Technology Roadmap
技 术 特 色
Product Advantages
1. 搭建领先的空间多组学高端平台
中科新生命搭建了基于10x Genomics CytAssist空间转录组平台、基于Bruker最新MALDI 2 Tims-Tof flex深度空间代谢组平台和基于显微切割的超精细空间蛋白质组平台。
空间转录组：采用10× Genomics CytAssist技术平台测量完整组织切片的mRNA，将mRNA的空间信息与形态学内容相结合，并绘制所有基因表达发生的位置，获得生物过程复杂而完整的基因表达图谱。此平台无须透化优化/贴片测试，操作流程更简便，也节省了样本使用量，同时具有检测灵敏度高、可选更大的捕获面积等优势。中科新生命可提供组织样品准备、样品检测、文库构建、测序到数据分析的全流程服务。
空间蛋白质组：中科新生命拥有丰富的空间样本处理经验以及优质的蛋白质组学平台，提供样本制备（组织包埋、组织切片、LCM激光显微切割）、数据检测（4D-DIA）、生信分析的一站式服务，并可兼容包括新鲜冷冻样本、FFPE样本在内的多种类型组织。
深度空间代谢组：中科新生命作为国内首家引入MALDI 2 Tims-Tof flex平台的服务商，开发了一站式高端版的深度空间代谢组学分析解决方案，通过增加分子分离维度和对“后电离”技术的创新应用，实现对代谢物进行空间分布分析的同时完成高深度的定性定量。同时借Smartbeam3D激光器实现激光的精准聚焦，可以实现惊人的5μm亚细胞级空间成像分析。
实测项目经验部分展示：
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样本类型 |
成像分辨率 |
feature数 |
定性数量 |
|
小鼠皮肤 |
20um |
2941 |
1167 |
|
小鼠脑肿瘤 |
50um |
3369 |
1021 |
|
小鼠脑组织 |
50um |
2802 |
992 |
|
人肝脏组织 |
50um |
2753 |
948 |
|
人淋巴组织 |
50um |
4528 |
807 |
|
红豆杉叶片 |
10um |
3510 |
911 |
|
大豆种子 |
20um |
3695 |
1225 |
|
橘子皮 |
10um |
1595 |
437 |
2. 打通湿实验路线
针对不同包埋方法(CMC、OCT等)进行优化测试后，最终选择对样本进行OCT包埋，对包埋组织进行连续切片，相邻的组织切片分别用于空间转录组、空间蛋白质组和空间代谢组研究，并结合组织学染色结果，为空间多组学研究提供无限可能。
3. 丰富的多组学联合分析内容
根据spot信息，开发空间映射和高端整合对齐算法，获取多个维度信息，可实现空间代谢+空间转录+空间蛋白三组学或者两组学的联合方案，对数据进行深入的挖掘。部分实测分析内容展示如下：
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 |
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| 图像对齐后坐标整合（空转+空代） | 空间分群（空转+空代） |
UMAP分群（空转+空代） |
4. 项目经验丰富
作为行业多组学产品服务龙头公司，中科新生命自搭建空间多组学平台以来，陆续协助客户完成超200+个项目，处理800+样本，积累丰富的项目经验，可以更好地为各位老师的空间组学项目研究保驾护航。部分切片经验展示：
应 用 场 景
Application Scenario
器官空间异质性研究
肿瘤免疫微环境研究
组织原位图谱研究
疾病病理进程研究
神经科学和发育生物学研究
应 用 案 例
Application Cases
1. Spatially resolved multi-omics deciphers bidirectional tumor-host interdependence in glioblastoma. Cancer Cell（IF= 50.3）
空间代谢组+空间蛋白质组+空间转录组
德国弗莱堡大学医学中心的Dieter Henrik Heiland团队通过空间分辨的转录组学、代谢组学和蛋白质组学来表征胶质母细胞瘤，确定以免疫和代谢应激因素为标志的隔离的微环境，揭示了局部区域肿瘤-宿主的相互依赖性，从而导致空间特定适应性转录程序的产生。此外，他们将胶质母细胞瘤干细胞模型植入人类和啮齿动物新皮质组织模拟各种环境，证实了转录状态源于对各种环境的动态适应。
2. APOE modulates microglial immunometabolism in response to age, amyloid pathology, and inflammatory challenge. Cell Reports（IF= 8.8）
空间代谢组+空间转录组+单细胞测序
University of Kentucky研究团队结合单细胞和空间多组学技术，系统地描述APOE4在大脑对衰老、外周炎症挑战和淀粉样蛋白病理学的反应中的作用（有氧糖酵解增加和脂质代谢途径的表达改变），并提出了结合代谢和炎症的治疗方法可能在治疗和预防AD方面具有极大的应用前景。
文献解读：
时空多组学 | 单细胞及空间多组学揭示APOE4在衰老、神经炎症和阿尔兹海默症中的作用机制
敲 重 点 ！
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