【客户文献】定量蛋白质组学的双子星座！
2019-03-12
中科新生命
2950客户发表文章1：
iTRAQ磷酸化蛋白质组学分析揭示DON在小肠上皮细胞的毒性作用机制
Toxins 2016, 8, 270; doi:10.3390/toxins8100270. IF:3.571
文章摘要：
脱氧雪腐镰刀菌烯醇（DON）是分布最广泛、污染最严重的霉菌毒素之一，其污染已成为饲料和食品安全的重要问题。DON可以引起毒害效应危害人和动物健康而备受关注。肠道是机体抵御摄入污染食物或饲料的第一道屏障。然而迄今为止DON 在小肠上皮细胞的毒性分子机制尚不清楚。
为深入研究DON在小肠上皮细胞的毒性作用机制，本研究将20μM DON暴露小肠上皮细胞(IPEC-J2) 60min，运用磷酸化iTRAQ定量蛋白质组学手段来筛选DON 毒性作用差异蛋白，并运用 Western blot对相关信号通路蛋白进行验证。结果表明，磷酸化iTRAQ 定量蛋白质组学鉴定了代表 1821 个磷酸化蛋白并且包含389 个磷酸化位点的4153 个磷酸化肽段。其中，代表255 个磷酸化蛋白的 289 个磷酸化肽段差异显著。通过GO 和 KEGG 通路富集分析，本研究发现除MAPKs 通路，DON 还能激活PI3K/Akt 和JAK/STAT 等信号通路。这些信号通路与调节细胞凋亡、肠上皮细胞屏障功能、肠上皮细胞炎症反应及葡萄糖吸收等生物学过程密切相关。
客户发表文章2：
采用label free技术定量分析CSL（Ca2+-dependent GalNAc/Man-specific lectin）对酵母的调节影响
Int J Biol Macromol. 2016 Apr;85:530-8. doi: 10.1016/j.ijbiomac. IF:3.138
文章摘要：
作者在青蛤（Cyclinasinensis）中分离到了CSL（Ca2+-dependent GalNAc/Man-specific lectin），并且发现其对酵母细胞产生酒精的过程具有刺激和调节作用。该团队采用label free定量技术分析了与CSL共培养24h后酵母细胞的蛋白质组变化。该研究一共鉴定到1410个蛋白质，其中117个蛋白质变化显著，其中24个上调，93个下调。经过对这些差异蛋白质进一步的生信分析发现这些差异蛋白质中有大量的酶类，这些都显示CSL通过调节众多的代谢通路从而影响酒精的产率。该研究为进一步揭示CSL调节发酵过程的具体分子机制积累了大量数据奠定了基础，也为类似的研究提供了可供参考的依据。
蛋白|修饰|代谢|脂质|结构确证
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