转录组测序 • miRNA/外泌体miRNA测序
· 产品定义
采用 Illumina 测序平台,研究某一物种特定组织在特定状态下的已知 Small RNA,也可发现新的物种或组织特异miRNA并预测其靶基因,为研究miRNA 的功能及此物种的基因调控机制提供有力工具,广泛应用于动植物的研究和医学领域。
· 技术路线
· 技术优势
1. 质量稳定、质控严格
2. 微量建库样品起始量低
3. 物种经验丰富
· 数据分析
服务标准 |
分析内容 |
拟解决问题 |
标准数据分析 |
small RNA 分类注释 |
获得多类型small RNA 分类信息 |
已知miRNA 特征分析 |
获得基因的表达丰度 |
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已知miRNA 表达量分析 |
获得差异表达、趋势聚类信息 |
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靶基因预测 |
获得靶基因对应的富集功能信息等 |
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新miRNA预测 |
发现新miRNA基因 |
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高级数据分析 |
miRNA-mRNA 调控网络分析 |
构建调控网络 |
· 部分数据分析结果展示
· 推荐应用领域
1. 外泌体:细胞间或远端细胞的表达调控
2. 临床或转化医学:疾病标志物挖掘与鉴定
3. 育种或抗逆研究:ceRNA调控网络
· 送样建议
样本类型 |
推荐送样量 |
新鲜植物组织 |
叶片、花≥100mg;根、茎、种子等其他组织≥2g |
新鲜动物组织 |
内脏组织、脑组织≥200mg;脂肪、皮肤、骨头、血管等其他组织≥2g |
新鲜培养细胞 |
≥1*107个 |
新采集的全血 (加入 TRIzol) |
≥4mL |
血清血浆 |
≥5mL |
外泌体沉淀 |
1010个/ml,30ul(外泌体) |
菌体 |
>200mg |
· 应用案例
文章题目:The miR-23a/27a/24 - 2 cluster drives immune evasion and resistance to PD-1/PD-L1 blockade in non-small cell lung cancer
在非小细胞肺癌中,miR-23a/27a/24 -2簇驱动免疫逃避和对PD-1/PD-L1阻断的抵抗
发表期刊:《Mol Cancer》(IF=27.7) 发表年份:2024年