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转录组测序 • miRNA/外泌体miRNA测序

 

· 产品定义

采用 Illumina 测序平台,研究某一物种特定组织在特定状态下的已知 Small RNA,也可发现新的物种或组织特异miRNA并预测其靶基因,为研究miRNA 的功能及此物种的基因调控机制提供有力工具,广泛应用于动植物的研究和医学领域。

 

· 技术路线

技术路线

 

· 技术优势

1. 质量稳定、质控严格

2. 微量建库样品起始量低

3. 物种经验丰富

 

· 数据分析

服务标准

分析内容

拟解决问题

标准数据分析

small RNA 分类注释

获得多类型small RNA 分类信息

已知miRNA 特征分析

获得基因的表达丰度

已知miRNA 表达量分析

获得差异表达、趋势聚类信息

靶基因预测

获得靶基因对应的富集功能信息等

新miRNA预测

发现新miRNA基因

高级数据分析

miRNA-mRNA 调控网络分析

构建调控网络

 

· 部分数据分析结果展示

 

· 推荐应用领域

1. 外泌体:细胞间或远端细胞的表达调控

2. 临床或转化医学:疾病标志物挖掘与鉴定

3. 育种或抗逆研究:ceRNA调控网络

 

· 送样建议

样本类型

推荐送样量

新鲜植物组织

叶片、花≥100mg;根、茎、种子等其他组织≥2g

新鲜动物组织

内脏组织、脑组织≥200mg;脂肪、皮肤、骨头、血管等其他组织≥2g

新鲜培养细胞

≥1*107个

新采集的全血 (加入 TRIzol)

≥4mL

血清血浆

≥5mL

外泌体沉淀

1010个/ml,30ul(外泌体)

菌体

>200mg

 

· 应用案例

文章题目:The miR-23a/27a/24 - 2 cluster drives immune evasion and resistance to PD-1/PD-L1 blockade in non-small cell lung cancer

在非小细胞肺癌中,miR-23a/27a/24 -2簇驱动免疫逃避和对PD-1/PD-L1阻断的抵抗

发表期刊:《Mol Cancer》(IF=27.7)  发表年份:2024年