修饰蛋白定量分析 • 奥斯卡DIA乳酸化蛋白质组
· 产品定义
蛋白乳酸化修饰(Lactylation)是2019年发现的一种新的蛋白质翻译后修饰,发生在赖氨酸(K)上。最初的乳酸化是在组蛋白上被发现,且被证明参与受细菌感染的M1巨噬细胞的稳态调控[1]。随后,越来越多的研究表明,非组蛋白上也广泛分布着乳酸化。目前认为,组蛋白上的乳酸化通过改变染色体结构、调控转录因子结合以及调节基因启动子区域的可及性影响基因表达;非组蛋白上的乳酸化通过空间位阻、构象改变和电荷中和调节蛋白质功能,如通过影响分子互作、酶活性、亚细胞定位等影响蛋白质的功能,发挥调控功能。奥斯卡DIA乳酸化蛋白质组采用高特异性乳酸化抗体树脂富集乳酸化修饰肽段,同时使用赛默飞Astral高分辨质谱仪进行DIA全扫描数据采集。高特异性乳酸化肽段富集方法+Astral质谱仪优越的性能+DIA全扫描数据采集模式成就高深度乳酸化蛋白质组检测。
· 技术路线
修饰肽段使用乳酸化抗体树脂进行富集,富集后的肽段使用Astral高端质谱仪进行DIA模式的检测。由于发生乳酸化修饰的赖氨酸共价连接乳酸分子,分子质量会相应增加72.021Da,数据库搜索时,根据分子质量偏移,锁定乳酸化修饰肽段及位点。
· 数据分析
标准数据分析内容 |
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鉴定分析 |
鉴定与定量结果统计;单个样本蛋白质鉴定结果统计;韦恩图 |
表达差异分析 |
差异结果统计;差异结果柱状图;火山图;聚类分析图; |
功能分析 |
亚细胞定位、结构域分析;GO功能分析、KEGG通路分析;互作网络分析、转录因子分析、激酶分析、WGCNA分析 |
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· 推荐组合产品
- 奥斯卡DIA蛋白质组+奥斯卡DIA磷酸化蛋白质组
- 奥斯卡DIA乳酸化蛋白质组+奥斯卡DIA乙酰化
· 推荐应用领域
- 生理病理过程中的乳酸化分子特征分析
- 疾病分子机制挖掘
- 临床大队列样本分析,如肿瘤、心血管等重大疾病精准分型
· 送样建议
样品类型 |
推荐送样量 |
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动物组织类 |
常规动物组织(脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉、皮肤等) |
≥100mg |
植物组织类 |
柔软组织(木本植物的叶、花等,草本科植物,藻类,蕨类植物,大型真菌等) |
≥1g |
细胞样品 |
悬浮/贴壁培养细胞 |
≥2×10^7 |
微生物类 |
细菌类 |
≥200mg |
· 参考文献
1. Zhang D, Tang Z, Huang H, et al. Metabolic regulation of gene expression by histone lactylation. Nature. 2019;574(7779):575-580
2. Yang Z, Zheng Y, Gao Q. Lysine lactylation in the regulation of tumor biology. Trends Endocrinol Metab. Published online February 22, 2024.