合作交流
合作交流 请填写您的需求表格,我们会安排专业的工作人员与您联系 X
姓名
单位/课题组
研究方向
电话
邮箱
咨询内容
验证码
重置

修饰蛋白定量分析 • 奥斯卡DIA乳酸化蛋白质组

 

· 产品定义

蛋白乳酸化修饰(Lactylation)是2019年发现的一种新的蛋白质翻译后修饰,发生在赖氨酸(K)上。最初的乳酸化是在组蛋白上被发现,且被证明参与受细菌感染的M1巨噬细胞的稳态调控[1]。随后,越来越多的研究表明,非组蛋白上也广泛分布着乳酸化。目前认为,组蛋白上的乳酸化通过改变染色体结构、调控转录因子结合以及调节基因启动子区域的可及性影响基因表达;非组蛋白上的乳酸化通过空间位阻、构象改变和电荷中和调节蛋白质功能,如通过影响分子互作、酶活性、亚细胞定位等影响蛋白质的功能,发挥调控功能。奥斯卡DIA乳酸化蛋白质组采用高特异性乳酸化抗体树脂富集乳酸化修饰肽段,同时使用赛默飞Astral高分辨质谱仪进行DIA全扫描数据采集。高特异性乳酸化肽段富集方法+Astral质谱仪优越的性能+DIA全扫描数据采集模式成就高深度乳酸化蛋白质组检测。

 

· 技术路线

修饰肽段使用乳酸化抗体树脂进行富集,富集后的肽段使用Astral高端质谱仪进行DIA模式的检测。由于发生乳酸化修饰的赖氨酸共价连接乳酸分子,分子质量会相应增加72.021Da,数据库搜索时,根据分子质量偏移,锁定乳酸化修饰肽段及位点。

 

· 数据分析

标准数据分析内容

鉴定分析

鉴定与定量结果统计;单个样本蛋白质鉴定结果统计;韦恩图

表达差异分析

差异结果统计;差异结果柱状图;火山图;聚类分析图;

功能分析

亚细胞定位、结构域分析;GO功能分析、KEGG通路分析;互作网络分析、转录因子分析、激酶分析、WGCNA分析

关于个性化数据分析需求,请来电咨询

 

 

· 推荐组合产品

  • 奥斯卡DIA蛋白质组+奥斯卡DIA磷酸化蛋白质组
  • 奥斯卡DIA乳酸化蛋白质组+奥斯卡DIA乙酰化

 

· 推荐应用领域

  • 生理病理过程中的乳酸化分子特征分析
  • 疾病分子机制挖掘
  • 临床大队列样本分析,如肿瘤、心血管等重大疾病精准分型

 

· 送样建议

样品类型

推荐送样量

动物组织类

常规动物组织(脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉、皮肤等)

≥100mg

植物组织类

柔软组织(木本植物的叶、花等,草本科植物,藻类,蕨类植物,大型真菌等)

≥1g

细胞样品

悬浮/贴壁培养细胞

≥2×10^7

微生物类

细菌类

≥200mg

 

· 参考文献

1.  Zhang D, Tang Z, Huang H, et al. Metabolic regulation of gene expression by histone lactylation. Nature. 2019;574(7779):575-580

2.  Yang Z, Zheng Y, Gao Q. Lysine lactylation in the regulation of tumor biology. Trends Endocrinol Metab. Published online February 22, 2024.