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靶向蛋白质组 • SomaScan 7K/11K蛋白质组

 

· 产品定义

超高深度靶向蛋白质检测SomaScan 7K/11K是基于Somalogic公司开发的SomaScan平台,通过一种与抗体具有相似亲和力的核酸适配体特异性地识别和定量目标蛋白,同时实现蛋白检测的深、稳、准三位一体,适用于大规模的蛋白质组分析,尤其是血液蛋白质组。

 

· 技术路线

 

· 技术优势

1. 深度覆盖:血液蛋白组覆盖创记录,同时靶向11000种蛋白

2. 准确可靠:蛋白亲和度媲美抗体法,受到FDA认可

3. 严格稳定:超高定量稳定性且无惧批次效应,万人级别队列应用

 

· 数据分析

分析内容 分析模块 具体分析内容
标准数据分析 基础分析 鉴定数量统计,临床统计,质控
差异分析 火山图,HPA注释
功能分析 GO,KEGG,GSEA,ssGSEA,趋势聚类
个性化分析 标志物 特征权重及组合筛选,标志物的表达水平,标志物模型构建、评价及比较,疾病风险因素分析(含协变量校正),临床指标关联分析
分子分型 疾病的分子轮廓与分子表达,聚类分型,亚型的靶点与药物敏感性筛选,免疫分型,多组学表达关联,关键分子的功能机制探索
纵向队列 时序表达分析,时序模块分析,时序临床关联与标志物分析
其他 根据客户需求

 

· 部分数据结果展示

 

· 推荐组合产品

1. 血液pQTL及药物靶点发现:SomaScan 7K/11K蛋白质组+基因测序/甲基化芯片

2. 血液标志物发现及临床转化:SomaScan 7K/11K蛋白质组(可联合其他组学)+AI学习专利算法+临床试剂盒开发

3. 创新药物探索性临床评价与研究:SomaScan 7K/11K蛋白质组(可联合其他组学)+深度机理挖掘+响应预测模型

 

· 推荐应用领域

1. 科学研究论文发表

2. 生物银行构建

3. 临床诊断

4. 药物探索性临床试验

 

· 送样建议

样本类型 送样量 预处理及保存
血浆 ≥130μL 收集全血样本后立即室温 2200g离心15min;取上清,注意不要吸到血浆与血细胞的交界处和血细胞层;-80°C保存
血清 ≥130μL 收集全血样本在室温下静置 60-90min,2200g离心15min;在离心后的30min内,取上层淡黄色血清样品于样本管中;-80°C保存

 

· 高分文章

文章题目:Evaluation of Large-Scale Proteomics for Prediction of Cardiovascular Events

基于somascan平台构建ASCVD风险预测蛋白评分

发表期刊:JAMA(IF=120.7) 发表年份:2023年