定量蛋白质组 • 奥斯卡深度血液蛋白质组
· 产品定义
奥斯卡深度血液蛋白质组学是基于新一代OrbitrapTM AstralTM 高分辨质谱仪平台，采用纳米颗粒特异性富集血液样本中低丰度蛋白，并结合DIA（数据非依赖采集模式）实现了蛋白质组学在覆盖深度、灵敏度、通量方面的全面性提升。对血液蛋白进行研究有助于揭示机体的生理和病理状态，寻找与疾病相关的生物标志物，在早期诊断和临床治疗上具有重要意义。
· 技术路线
· 技术优势
· 数据分析
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标准数据分析内容 |
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鉴定分析 |
鉴定与定量结果统计；单个样本蛋白质鉴定结果统计；韦恩图；主成分分析；PCC分析；RSD分析；蛋白质丰度分析 |
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差异表达分析 |
差异结果统计；火山图；箱线图；雷达图；聚类分析 |
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功能分析 |
亚细胞定位；结构域分析；GO功能分析；KEGG/Reactome/ WikiPathways通路分析；GSEA分析；转录因子分析；互作网络分析；WGCNA分析；ROC分析 |
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质量控制 |
QC样本评价；组间样本鉴定评价；样本定量波动评价；DIA体系评价 |
· 部分数据分析结果展示
· 推荐组合产品
1. 奥斯卡深度血液蛋白质组学+PRM验证蛋白质组学
2. 奥斯卡深度血液蛋白质组学+代谢组学
· 推荐应用领域
1. 临床大队列蛋白组学与精准医疗
2. 疾病生物标志物与药物作用靶点高通量分析
· 送样建议
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样本类型 |
送样建议 |
预处理及保存 |
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血清 |
≥100μL |
收集好的全血室温静置两小时(避免剧烈晃动以免发生溶血)，2000-3000g离心10min，取上层淡黄色血清样品置于EP管中，液氮速冻，-80℃保存。 |
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血浆 |
≥100μL |
收集好的全血加入抗凝剂或者直接抽血与抗凝管中，轻轻颠倒5-10次混匀，静置30min（避免剧烈晃动以免发生溶血），1300g-2000g离心10min，取上清，液氮速冻，-80℃保存。 |
· 应用案例
1. Evaluating the Performance of the Astral Mass Analyzer for Quantitative Proteomics Using Data-Independent Acquisition. J Proteome Res. 2023.
使用DIA评估Astral质量分析仪的定量蛋白质组学的性能
2. Rapid, deep and precise profiling of the plasma proteome with multi-nanoparticle protein corona. Nat Commun.2020
纳米石墨烯磁珠吸附法，特异性吸附中低丰度蛋白