定量蛋白质组 • 奥斯卡DIA、4D DIA蛋白质组
· 产品定义
奥斯卡DIA蛋白质组学是基于赛默飞新一代 OrbitrapTM AstralTM 高分辨质谱仪开发的高深度蛋白质组定性定量技术服务，具有更高通量、更高灵敏度、更深覆盖和精准定量的特点，能实现超10000个蛋白质的检出。
4D DIA蛋白质组是基于布鲁克的timsTOF 系列高分辨质谱仪，在传统3D分离（保留时间、质荷比、离子强度）基础上，增加了第四维度的离子淌度，通过捕集离子淌度（tims）与同步累积连续碎裂（PASEF）扫描模式进行定量蛋白组学研究。
· 技术路线
· 技术优势
1. 全扫描模式:数据非依赖性采集模式,大大减少高丰度干扰,全面采集高低丰度信号,数据覆盖度较DDA提高近40%
2. 超高重现性、稳定性:大样本鉴定重复率较DDA提升近40%,定量精密度提升近1倍
3. 超高定量准确度∶定量能力接近金标准PRM靶向技术
4. OrbitrapTM AstralTM 和timsTOF 系列质谱双轮驱动，检测通量高
· 数据分析
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标准数据分析内容 |
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鉴定分析 |
鉴定与定量结果统计；单个样本蛋白质鉴定结果统计；韦恩图；主成分分析；PCC分析；RSD分析；蛋白质丰度分析 |
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差异表达分析 |
差异结果统计；火山图；箱线图；雷达图；聚类分析图 |
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功能分析 |
亚细胞定位；结构域分析；GO功能分析；KEGG/Reactome/ WikiPathways通路分析；GSEA分析；转录因子分析；激酶分析；互作网络分析；WGCNA分析 |
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质量控制 |
QC样本评价；组间样本鉴定评价；样本定量波动评价；DIA体系评价 |
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高级数据分析 |
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临床药物研究 |
药物靶点注释 |
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标志物的筛选 |
集成机器学习 |
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分子分型 |
无监督聚类分型分析 |
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关于个性化数据分析需求，请来电咨询 |
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· 部分数据分析结果展示
· 推荐组合产品
1. 临床大队列研究“黄金”联合：奥斯卡DIA蛋白质组+DIA磷酸化蛋白质组
2. 标志物研究“一站式”解决方案：奥斯卡DIA蛋白质组+PRM、4D DIA+PRM
· 推荐应用领域
1. 临床疾病标志物筛选
2. 肿瘤疾病分子分型
3. 作物发育与品系比较
· 送样建议
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样品类型 |
推荐样本量 |
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动物组织类 |
常规动物组织（脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉等） |
≥2mg |
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植物组织类 |
柔软组织（木本植物的叶、花等，草本科植物，藻类，蕨类植物，大型真菌等） |
≥50mg |
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微生物类 |
菌类 |
≥20mg |
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细胞样品 |
悬浮/贴壁培养细胞 |
≥0.5× 10^7 |
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体液样本 |
血清/血浆 |
≥0.05mL |
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外泌体 |
血浆（未提取外泌体） |
≥200μL |
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提取完成的外泌体 |
≥20μg |
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其他类 |
细胞上清 |
≥2mL |
· 应用案例
文章题目： Unique DUOX2+ACE2+ small cholangiocytes are pathogenic targets for primary biliary cholangitis
利用4D DIA蛋白质组发现原发性胆管炎的致病靶点
发表期刊： Nature Communications（IF=14.7） 发表年份：2023年
合作单位：第三军医大学第一附属医院