修饰蛋白定量分析 • 甲基化蛋白质组
· 产品定义
蛋白甲基化(Methylation)能修饰组蛋白、转录因子等蛋白,参与基因表达调控、相互作用等多种过程中,其发生过程是在甲基酶的作用下将甲基转移到蛋白质的特定氨基酸残基上。蛋白质的甲基化通常发生在精氨酸和赖氨酸上。精氨酸甲基化有两种模式:单甲基化和双甲基化(二甲基化),双甲基化又可分为非对称甲基化和对称甲基化。赖氨酸甲基化有三种模式,单甲基化、双甲基化或三甲基化。甲基化修饰导致分子量增加,质谱可准确测定这些分子量的变化,实现对甲基化修饰位点的定性定量分析。
4D Label free甲基化蛋白质组是基于布鲁克timsTOF Pro质谱仪,通过数据依赖性采集-同步累积连续碎裂(ddaPASEF)扫描模式进行甲基化蛋白质组学分析。4D Label free修饰组,利用了离子淌度分离,能根据分子的形状、截面积属性,可有效区分修饰同分异构多肽,极大提高修饰的鉴定深度,以更少上样量、更快扫描速度,实现蛋白质组学在覆盖深度、灵敏度、通量方面的全面性提升。
· 技术路线
产品类型 |
修饰位点 |
富集方法 |
4D Label free精氨酸单甲基化 |
Arg |
Mono-Methyl Arginine基序抗体 |
4D Label free精氨酸对称双甲基化 |
Arg |
Symmetric Di-Methyl Arginine基序抗体 |
4D Label free精氨酸非对称双甲基化 |
Arg |
Asymmetric Di-Methyl Arginine基序抗体 |
4D Label free赖氨酸甲基化 |
Lys |
Pan-Methyl Lysine基序抗体,同时富集单甲基化、双甲基化及三甲基化肽段 |
· 技术优势
1. 4D技术加持,提高定量的准确性、鉴定深度,更加适合微量样本
2. 基于质谱平台(Bruker timsTOF pro),检测速度提升近一倍
3. 采用进口金标抗体,数据结果稳定可靠
· 数据分析
标准数据分析内容 |
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鉴定分析 |
鉴定与定量结果统计;单个样本蛋白质鉴定结果统计;韦恩图 |
表达差异分析 |
差异结果统计;差异结果柱状图;火山图;聚类分析图; |
功能分析 |
亚细胞定位;结构域分析;GO功能分析;KEGG通路分析;互作网络分析 |
质量控制分析 |
肽段离子质量偏差分布、肽段例子得分分布、蛋白质丰度比分布 |
高级数据分析 |
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功能分析 |
GSEA富集分析 |
临床药物研究 |
药物靶点注释 |
标志物筛选 |
集成机器学习 |
与临床表征的联合分析 |
ROC分析;WGCNA分析 |
关于个性化数据分析需求,请来电咨询 |
· 推荐应用领域
1. 染色质结构以及转录调控
2. 稳定蛋白质,调控蛋白转录以及结合活性、DNA复制和损伤
3. 癌症、衰老、老年痴呆等许多疾病密切相关,是表观遗传学的重要研究内容
· 送样建议
样品类型 |
推荐样本量 |
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动物组织类 |
常规动物组织(脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉、皮肤等) |
≥ 75mg |
植物组织类 |
柔软组织(木本植物的叶、花等,草本科植物,藻类,蕨类植物,大型真菌等) |
≥ 250mg |
细胞样品 |
悬浮/贴壁培养细胞 |
≥ 3×10^7 |
微生物类 |
菌类 |
≥ 120mg |