修饰蛋白定量分析 • 乙酰化修饰及其他酰化蛋白质组
· 产品定义
蛋白质乙酰化修饰由乙酰基转移酶和去乙酰化酶共同调节,通过感应代谢环境变化而变化,同时其常在代谢酶上发生修饰,进而调控代谢通路及代谢酶的活性,参与下游代谢物变化。蛋白质乙酰化(acetylation)是最常见的酰化修饰类型,是指在乙酰基转移酶的催化下把乙酰基团(如乙酰辅酶A等供体)共价结合到底物蛋白质的赖氨酸残基上的过程,主要发生在蛋白质赖氨酸残基的ε-NH2位,其分子质量会相应增加42.01Da,质谱能够准确地测定分子量是否发生相应的质量偏移,实现酰化修饰肽段及位点的分析。
4D Label free乙酰化蛋白质组是基于布鲁克timsTOF Pro质谱仪,通过数据依赖性采集-同步累积连续碎裂(ddaPASEF)扫描模式进行乙酰化蛋白质组学分析。4D Label free修饰组,利用了离子淌度分离,能根据分子的形状、截面积属性,可有效区分修饰同分异构多肽,极大提高修饰的鉴定深度,以更少上样量、更快扫描速度,实现蛋白质组学在覆盖深度、灵敏度、通量方面的全面性提升。
· 技术路线
产品类型 |
修饰位点 |
富集方法 |
4D Label free乙酰化 |
Lys |
Acetyl-Lysine基序抗体 |
4D Label free琥珀酰化 |
Lys |
Succinyl-Lysine基序抗体 |
4D Label free丙酰化 |
Lys |
Propionyl-Lysine基序抗体 |
4D Label free丙二酰化 |
Lys |
Malonyl-Lysine基序抗体 |
4D Label free戊二酰化 |
Lys |
Glutaryl-Lysine基序抗体 |
· 技术优势
1. 4D技术加持,提高定量的准确性、鉴定深度,更加适合微量样本
2. 基于质谱平台(Bruker timsTOF pro),检测速度提升近一倍
3. 采用进口金标抗体,数据结果稳定可靠
4. 助力客户发表多篇文章
· 数据分析
标准数据分析内容 |
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鉴定分析 |
鉴定与定量结果统计;单个样本蛋白质鉴定结果统计;韦恩图 |
表达差异分析 |
差异结果统计;差异结果柱状图;火山图;聚类分析图; |
功能分析 |
亚细胞定位;结构域分析;GO功能分析;KEGG通路分析;互作网络分析 |
质量控制分析 |
肽段离子质量偏差分布、肽段例子得分分布、蛋白质丰度比分布 |
高级数据分析 |
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功能分析 |
GSEA富集分析 |
临床药物研究 |
药物靶点注释 |
标志物筛选 |
集成机器学习 |
与临床表征的联合分析 |
ROC分析;WGCNA分析 |
关于个性化数据分析需求,请来电咨询 |
· 推荐组合产品
打通表型-机制研究:乙酰化组+代谢组。
· 推荐应用领域
1. 能量代谢调控
2. 代谢综合征研究
3. 真菌细菌研究
· 送样建议
样品类型 |
推荐送样量 |
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动物组织类 |
常规动物组织(脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉、皮肤等) |
≥ 75m |
植物组织类 |
柔软组织(木本植物的叶、花等,草本科植物,藻类,蕨类植物,大型真菌等) |
≥ 300mg |
细胞样品 |
悬浮/贴壁培养细胞 |
≥ 3×10^7 |
微生物类 |
菌类 |
≥ 150mg |
· 应用案例
1. HDAC6-dependent deacetylation of AKAP12 dictates its ubiquitination and promotes colon cancer metastasis. 2022. Cancer letters(IF 9.7)
乙酰化蛋白质组揭示HDAC6促进结肠癌转移的作用机制
2. Sirt3 is a novel target to treat sepsis induced myocardial dysfunction by acetylated modulation of critical enzymes within cardiac tricarboxylic acid cycle. 2020. Pharmacological Research (IF 9.3)
乙酰化蛋白质组揭示脓毒症引起的心肌功能障碍的治疗机制
3. GhHSP24. 7 mediates mitochondrial protein acetylation to regulate stomatal conductance in response to abiotic stress in cotton. 2022. The Crop Journal(IF 4.745)
乙酰化蛋白质组揭示GhHSP2.7介导线粒体蛋白乙酰化调节棉花对非生物胁迫的气孔导度