修饰蛋白定量分析 • 4D-DIA磷酸化蛋白质组学

· 产品定义

蛋白质磷酸化修饰（Phosphorylation）是生物体内最重要的共价修饰方式之一，是目前分布最多、也是最广泛研究的修饰，其发生过程是在激酶（kinase）催化下，将ATP的磷酸根基团转移到蛋白的氨基酸（Ser、Tyr、Thr）侧链上。蛋白质的磷酸化和去磷酸化这一可逆过程调节着包括细胞增殖、发育、分化、信号转导、细胞凋亡、神经活动、肌肉收缩及肿瘤发生等过程在内的所有生命活动。发生磷酸化修饰的氨基酸上共价连接磷酸基团，其分子质量会增加79.97Da。利用质谱可测定分子量是否发生79.97Da的质量偏移，从而检测磷酸化修饰肽段及位点。

4D-DIA磷酸化蛋白质组采用IMAC富集策略提升S/T/Y磷酸化修饰肽段数量，基于数据非依赖采集（Data-Independent Acquisition，DIA）技术，无偏向性采集质谱扫描范围内所有信号。同时，在4D质谱仪（布鲁克timsTOF Pro/Pro2质谱仪）检测时，增加离子淌度分离，可有效区分修饰同分异构多肽，极大提高修饰的鉴定深度及准确性。

· 技术路线

技术路线

· 技术优势

1. 全扫描模式：数据非依赖性采集模式，大大减少高丰度干扰，全面采集高低丰度信号，数据覆盖度提高近40%

2. 提供激酶-药靶分析，助力客户进行激酶药靶发现

3. 磷酸化蛋白质组技术经验丰富，助力客户发表超60文章

4. 系统解决方案——提供修饰组学至验证、上下游联合分析，实现快捷”一站式”服务

· 数据分析

标准数据分析内容
鉴定分析	鉴定与定量结果统计；单个样本蛋白质鉴定结果统计；韦恩图
表达差异分析	差异结果统计；差异结果柱状图；火山图；聚类分析图；
功能分析	亚细胞定位；结构域分析；GO功能分析；KEGG通路分析；互作网络分析
质量控制分析	肽段离子质量偏差分布、肽段例子得分分布、蛋白质丰度比分布
高级数据分析
激酶-药靶分析	激酶注释、激酶—底物关系分析、激酶活性分析、激酶药物靶点注释、GSEA分析激酶介导的关键信号通路、激酶树注释
功能分析	GSEA富集分析
临床药物研究	药物靶点注释
与临床表征的联合分析	ROC分析；WGCNA分析
关于个性化数据分析需求，请来电咨询

· 推荐组合产品

1. 4D-DIA蛋白质组 + 4D-DIA磷酸化蛋白质组；

2. 高通量检测+验证“一站式”解决方案：4D-DIA磷酸化蛋白质组+PRM磷酸化

· 推荐应用领域

医学方向：

· 临床大队列样本分析，如肿瘤、心血管等重大疾病精准分型

· 生物样本信息库构建：DIA可实现生物信息的完整保存，为后续回溯分析提供保障

· 疾病发生发展机制研究

· 疾病激酶靶点发现

· 药理、毒理、基因作用机制研究

农学方向：

· 作物群体性状等大规模样本研究，如育种品系、胁迫干预等

· 植物、微生物生长发育与胁迫逆境生理研究

· 送样建议

样品类型		推荐送样量
动物组织类	常规动物组织（脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉、皮肤等）	≥75mg
植物组织类	柔软组织（木本植物的叶、花等，草本科植物，藻类，蕨类植物，大型真菌等）	≥250mg
细胞样品	悬浮/贴壁培养细胞	≥3×10^7
微生物类	菌类	≥120mg

· 应用案例

1. Evolution of enhanced innate immune evasion by SARS-CoV-2. Nature. 2021

DIA蛋白质组及DIA磷酸化蛋白质组学揭示新冠病毒如何逃避人体免疫系统

2. Data-Independent Acquisition-based global phosphoproteomics reveal the diverse roles of Casein kinase 1 in plant development. Science Bulletin. 2023

DIA磷酸化蛋白质组全面揭示I型酪蛋白激酶CK1在植物发育中的功能

3. Proteomics of resistance to Notch1 inhibition in acute lymphoblastic leukemia reveals targetable kinase signatures Nature Communications.2021

DIA蛋白质组+DIA磷酸化助力发现T-ALL白血病新药靶