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多组学联合分析 • 16S+代谢组联合分析

 

· 产品定义

基于16S+代谢组(非靶向/靶向代谢组)的组学数据,先从16S、代谢层面分别筛选组间差异的菌株和代谢物,然后基于两者表达量的相关性进行联合分析,多角度揭示特定菌群与特定代谢物(群)之间的关联性,筛选引起菌群代谢状态或功能性代谢小分子变化的关键菌株。

 

· 技术优势

1. 研究路线完整、创新:打通菌群多样性与功能

2. 通过对不同层面的表达水平相关性的分析,有利于关键菌群的筛选

 

· 数据分析

 

· 部分数据分析结果展示

 

· 推荐应用领域

1. 农林领域:抗逆胁迫机制,生长发育机制,育种保护研究等

2. 畜牧业:肉类及乳品质研究,致病机理研究等

3. 基础医学、临床诊断:生物标志物,疾病机理机制,疾病分型,个性化治疗等

4. 生物医药:药物作用机理,药效评价,药物开发等

5. 微生物领域:致病机理,耐药机制,病原体-宿主相互作用研究等

6. 海洋水产:渔业资源,海水养殖,渔业环境与水产品安全等

7. 生物能源、环境科学领域:发酵过程优化,生物燃料生产,环境危定风险评估研究等

8. 食品营养:食品储藏及加工条件优化,食品组分及品质鉴定,功能性食品开发,食品安全监检测等

 

· 应用案例

文献名称:Gut microbiota-mediated secondary bile acids regulate dendritic cells to attenuate autoimmune uveitis through TGR5 signaling

发表期刊:《Cell Reports》(IF=9.423)

合作单位:重庆医科大学第一附属医院

文章摘要:肠道微生物群介导的次级胆汁酸(BAs)通过G蛋白偶联受体和/或核受体在能量平衡和宿主代谢中发挥重要作用。新的证据表明,BAs通过这些受体对维持先天免疫反应很重要。然而,BAs对自身免疫性葡萄膜炎的影响尚不清楚。本文研究发现实验性自身免疫性葡萄膜炎(EAU)动物粪便和血清中与微生物群相关的次级BAs浓度降低。通过抑制树突状细胞(DC)中核因子κB(NFκB)相关的促炎细胞因子,恢复肠道BAs池可减轻EAU的严重程度。TGR5缺乏部分逆转了脱氧胆酸(DCA)对DC的抑制作用。TGR5信号还通过循环AMP(cAMP)-蛋白激酶A(PKA)途径抑制DC中NF-κB的激活。此外,DCA和TGR5激动剂均抑制人单核细胞源性DC激活。综上所述,本研究表明BA代谢在适应性免疫反应中起着重要作用,可能是自身免疫性葡萄膜炎的治疗靶点。