多组学联合分析 • 转录组+蛋白质组联合分析

· 产品定义

转录组学和蛋白质组学都是获得基因表达情况的重要工具，从生物学角度上看，转录组代表了基因表达的中间状态，可以反映诸如转录调控、转录后调控的机理；而蛋白质是生物体直接的功能执行者，因而对其表达水平的研究有着不可替代的优势。要全面探究生物体疾病机理、胁迫机制，精确研究重要基因的表达模式和调控机理，只有联合转录组学和蛋白组学表达量数据对生物样本进行系统研究，才能真正观察到mRNA-蛋白质关联性，进而从整体上解释生物学问题。

· 技术优势

1. 构建蛋白质数据库，大幅度提高蛋白质鉴定数量

2. 不同层面表达水平分析，构建表达“全景图”

3. 多组学交叉验证：深层次挖掘其中调控机制

4. 对基因突变信息在蛋白水平上进行验证

5. 精准医疗：实现genomics到protegenomics的转变

· 数据分析

· 部分数据分析结果展示

· 推荐应用领域

1. 农林领域：抗逆胁迫机制，生长发育机制，育种保护研究等

2. 畜牧业：肉类及乳品质研究，致病机理研究等

3. 基础医学、临床诊断：生物标志物，疾病机理机制，疾病分型，个性化治疗等

4. 生物医药：药物作用机理，药效评价，药物开发等

5. 微生物领域：致病机理，耐药机制，病原体-宿主相互作用研究等

6. 海洋水产：渔业资源，海水养殖，渔业环境与水产品安全等

7. 生物能源、环境科学领域：发酵过程优化，生物燃料生产，环境危定风险评估研究等

8. 食品营养：食品储藏及加工条件优化，食品组分及品质鉴定，功能性食品开发，食品安全监检测等

· 应用案例

文献名称：Trisomy 21–induced dysregulation of microglial homeostasis in Alzheimer’s brains is mediated by USP25

发表期刊：《Science Advances》（IF=14.136）

合作单位：南方医科大学

文章摘要：由21号染色体三体性引起的唐氏综合征（DS）是早发性阿尔茨海默病（AD）最重要的危险因素；然而，DS和AD之间的潜在联系机制仍不清楚。本研究发现小鼠DS-AD杂交小鼠模型（5×FAD）中，同源21号染色体基因的三倍化加重了神经炎症。USP25是一种由21号染色体编码的去偶素化酶，过表达Usp25会导致5×FAD小鼠脑中小胶质细胞激活，加重5×FAD小鼠突触功能和认知缺陷；而敲除Usp25基因则可以减轻小胶质细胞激活和神经炎症，逆转5×FAD小鼠的突触功能和认知缺陷。从机制上，研究团队发现USP25介导WDFY1和ATP6V0C的去泛素化修饰，从而减少小胶质细胞炎症因子释放及突触吞噬。该研究通过遗传学和药理学方法证明了21-三体与阿尔茨海默病中小胶质细胞激活和神经炎症的关联性，指出USP25可能作为阿尔茨海默病和唐氏综合征潜在的治疗靶点。