单细胞测序 • 单细胞转录组测序(10x Genomics)

 

· 产品定义

10x Genomics单细胞转录组测序通过微流控分选单个细胞，然后通过带有barcode和引物的磁珠与细胞结合，被油滴包裹形成油包水结构，实现了对大量细胞的快速高效标记、测序和分析，获得单细胞水平转录表达信息，并依据特征基因的表达对不同细胞群进行鉴定和注释，实现样本、细胞群之间的差异分析、细胞演化过程以及细胞与细胞间的相互作用等分析内容，从而获得高分辨率的细胞图谱。

 

· 技术路线

 

· 平台优势

1. 完备的细胞捕获平台（10x Genomics Chromium Controller仪器和Chromium X Series仪器）

2. 丰富的样本处理经验（已经积累多个物种的各种组织的样本）

3. 高标准实验环境，进口试剂耗材，最大限度消除各种不良因素影响，保障样本建库质量

4. 完善的生信团队，可根据客户需求提供标准化、个性化的数据分析解决方案

5.单细胞双平台，可提供单细胞转录和单细胞蛋白等单细胞多组学联合服务

 

· 数据分析

 

· 部分数据分析结果展示

 

· 推荐应用领域

1. 细胞图谱的构建

2. 细胞异质性及组织微环境研究

3. 免疫调控研究

4. 神经分化发育研究

5. 疾病机制研究

6. 药物动力学研究

7. 肿瘤异质性

8. 疾病靶点研究

9. 发育分化研究

10. 疾病进程研究

 

· 样本要求

1. 样品总量：制备成细胞悬浮液，一个样本的细胞起始量需大于1×10 5个

2. 样品浓度：最终上样捕获前细胞浓度在700 - 1,200 cells / μL

3. 细胞活性：活细胞数目在85 %以上

4. 细胞大小：直径小于40 μm

5. 细胞培养基及缓冲液不能含有Ca 2+和Mg 2+等影响酶活性的物质

6. 血液样本需要用EDTA抗凝管收集，不能采用含有肝素的抗凝管

7. 植物样本需制备成原生质体

 

· 推荐组合产品

1. 单细胞转录组+bulk RNA-seq/蛋白组学

2. 单细胞转录组+空间组学（空间转录组/空间代谢组）

3. 单细胞转录组+16s/宏基因组+代谢组

4. 单细胞转录组+基因组（WES/WGS）

5. 单细胞转录组+单细胞免疫组库

 

· 应用案例

       1. Single-cell RNA sequencing reveals S100a9hi macrophages promote the transition from acute inflammation to fibrotic remodeling after myocardial ischemia‒reperfusion. Theranostics.2024

单细胞测序-scRNA-seq显示S100a9hi巨噬细胞促进心肌缺血/再灌注后急性炎症向纤维化重塑的转变【客户文章】