定量蛋白质组 • TMT 标记蛋白质组

· 产品定义

TMT 标记蛋白质组(Tandem mass tag)是由ThermoFisher Scientific公司研发的一种多肽体外等重同位素标记的相对与绝对定量技术，采用6、10及16种同位素的标签，通过特异性标记多肽的氨基基团，经高分辨质谱仪串联分析，可同时比较多达16种样品之间的蛋白质表达量，是标记定量蛋白质组学中的高通量筛选技术。

· 技术路线

· 技术优势

1. 同一批次标记的样本统一处理，减少样本处理及实验误差，实验平行性较高

2. 同一批次标记定量稳定性高

3. 通过分级方法可大大增加蛋白鉴定深度

· 数据分析

标准数据分析内容
鉴定分析	鉴定与定量结果统计；单个样本蛋白质鉴定结果统计；韦恩图
表达差异分析	差异结果统计；差异结果柱状图；火山图；聚类分析图；
多组的比较分析（组别>=3）	mufzz聚类；雷达图；箱线图
功能分析	亚细胞定位；结构域分析；GO功能分析；KEGG通路分析；互作网络分析
质量控制分析	肽段离子质量偏差分布、肽段例子得分分布、蛋白质丰度比分布
高级数据分析
功能分析	GSEA富集分析
临床药物研究	药物靶点注释
标志物筛选	集成机器学习
与临床表征的联合分析	热图；弦图；ROC分析；WGCNA分析
关于个性化数据分析需求，请来电咨询

· 推荐应用领域

1. 农林领域：抗逆胁迫机制，生长发育机制，育种保护研究等

2. 畜牧业：肉类及乳品质研究，致病机理研究等

3. 基础医学、临床诊断：生物标志物，疾病机理机制，疾病分型，个性化治疗等

4. 生物医药：药物作用机理，药效评价，药物开发等

5. 微生物领域：致病机理，耐药机制，病原体-宿主相互作用研究等

6. 海洋水产：渔业资源，海水养殖，渔业环境与水产品安全等

7. 生物能源、环境科学领域：发酵过程优化，生物燃料生产，环境危定风险评估研究等

8. 食品营养：食品储藏及加工条件优化，食品组分及品质鉴定，功能性食品开发，食品安全监检测等

· 送样建议

样品类型		推荐样本量
动物组织类	常规动物组织（脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉、皮肤等）	≥30mg
植物组织类	柔软组织（木本植物的叶、花等，草本科植物，藻类，蕨类植物，大型真菌等）	≥100mg
微生物类	菌类	≥50mg
细胞样品	悬浮/贴壁培养细胞	≥1 × 10^7
体液样本	血清/血浆	≥100μL
外泌体	提取完成的外泌体	≥100μg
其他类	细胞上清	≥5mL

· 应用案例

1. Ago2 Protects Against Diabetic Cardiomyopathy by Activating Mitochondrial Gene Translation. Circulation. 2024.

TMT标记蛋白质组探究Ago2通过激活线粒体基因翻译预防糖尿病性心肌病的机制【客户文章】

2. Multi-Omics analysis reveals the unexpected immune regulatory effects of arsenene nanosheets in tumor microenvironment. ACS Applied Materials & Interfaces.2023.

TMT标记蛋白质组联合其他组学分析揭示肿瘤微环境的免疫调节作用【客户文章】

3. A de novo missense mutation in MPP2 confers an increased risk of Vogt–Koyanagi–Harada disease as shown by trio-based whole-exome sequencing. Cellular & Molecular Immunology. 2023.

TMT标记蛋白质组探究VKH病机制【客户文章】