空间原位技术 • 10x Xenium空间原位技术
· 产品定义
10x Xenium空间原位技术使用独特的锁式探针(padlock probe)设计,经过多轮滚环扩增依次与荧光探针杂交成像,通过解码原位荧光信号序列;同时利用多种形态学染料和专门设计的人工智能算法,对组织切片中的细胞进行精确分割,确定各个细胞的边界,从而实现目标基因在空间单细胞水平的高灵敏度、高特异性检测。目前10x Xenium空间原位技术的最大panel为Xenium Prime 5K Human/Mouse Pan Tissue & Pathways Panel集齐了人/小鼠各类组织器官的常见靶点,更全面的靶点检出让一次试验发现更多可能!
· 技术路线
· 技术优势
- 原位RNA检测,精准定位,防止RNA逸散和串扰
- 亚细胞分辨率,精确观测单个细胞内部的基因表达情况
- 细胞膜抗体染色+细胞质18s rRNA染色+细胞核边界拓展算法,精准分割细胞边界
- 超大5k gene panel泛组织通路覆盖,靶点检出更全面,一次试验发现更多可能
· 推荐应用领域
· 推荐组合产品
- 空间原位技术+空间转录组
- 空间原位技术+单细胞转录组
- 空间原位技术+空间代谢组
· 送样建议
样品类型 |
取样方法 |
质量要求 |
保存运输 |
新鲜组织 |
新鲜组织取样后立即进行OCT包埋处理,然后液氮速冻,-80℃保存。如无法立即进行包埋处理,则先将组织用干冰速冻后再进行OCT包埋。 |
RNA的 RIN值≥4,组织H&E染色完整、无明显空隙。 |
干冰运输 |
FFPE组织 |
建议将FFPE组织在固定和包埋后存储在4℃,以确保RNA的完整性。 |
RNA的DV200 > 30%,组织H&E染色完整、无明显空隙。 |
常温或冰袋运输 |
· 参考文献
1. Yunhe, Liu,Ansam, Sinjab,Jimin, Min et al. Conserved spatial subtypes and cellular neighborhoods of cancer-associated fibroblasts revealed by single-cell spatial multi-omics.[J] .Cancer Cell, 2025, 0: 0.
2. Amanda, Janesick,Robert, Shelansky,Andrew D, Gottscho et al. High resolution mapping of the tumor microenvironment using integrated single-cell, spatial and in situ analysis.[J] .Nat Commun, 2023, 14: 0.