修饰蛋白定量分析 • 奥斯卡DIA棕榈酰化蛋白质组

· 产品定义

蛋白质S-棕榈酰化修饰（（S-palmitoylation或S-acylation，简称棕榈酰化））是最常见的一种脂质修饰，即通过硫脂键将来源于棕榈酸的棕榈酰-辅酶A共价结合到蛋白的半胱氨酸（C）残基的修饰。棕榈酰化是一种可逆修饰，修饰和去修饰分别由棕榈酰基转移酶和脱棕榈酰化酶介导（修饰和去修饰酶均已知）。棕榈酰化和脱棕榈酰化循环持续影响或控制许多细胞和生理过程，棕榈酰化状态的改变与一系列人类疾病有关，从代谢性疾病到炎症性疾病、神经退行性疾病和癌症。

常用棕榈酰化蛋白质组存在的限制：

（1）缺乏富集棕榈酰化肽段的特异性抗体

（2）常规基于经典ABE（酰基生物素交换）法进行的棕榈酰化组检测实验过程繁琐、时间成本和试剂耗材成本高

（3）这种常规的棕榈酰化组学是蛋白水平的检测，严重缺乏棕榈酰化位点信息。这对于要在位点层面上去研究的蛋白翻译后修饰来说，极为尴尬，研究者往往还需要锁定了棕榈酰化蛋白质后再针对性检测棕榈酰化位点，无疑增加了工作周期。因此，开发高通量的、从棕榈酰化肽段/位点水平进行检测棕榈酰化组学技术变得尤为迫切。

奥斯卡DIA棕榈酰化组基于经典的ABE方法原理，经过充分优化和测试，最终实现修饰肽段/位点水平上的检测。同时，采用Astral高分辨质谱仪DIA检测，使棕榈酰化位点的检出深度达到新的高度。

· 技术路线

蛋白质棕榈酰化修饰先经过ABE法被还原为游离巯基（-SH）并被标记上生物素。随后，进行酶切，并使用链霉亲和素树脂特异性富集标记有生物素的肽段（原棕榈酰化肽段），随后洗脱肽段并使用Astral高端质谱仪进行DIA模式的检测。由于棕榈酰化位点在质谱检测前已经转化为烷基化修饰（固定修饰），因此，最终搜库即可确定原棕榈酰化位点。

技术路线

· 数据分析

标准数据分析内容
鉴定分析	鉴定与定量结果统计；单个样本蛋白质鉴定结果统计；韦恩图
表达差异分析	差异结果统计；差异结果柱状图；火山图；聚类分析图；
功能分析	亚细胞定位；结构域分析；GO功能分析；KEGG通路分析；互作网络分析、转录因子分析、激酶分析、膜蛋白分析、WGCNA分析
关于个性化数据分析需求，请来电咨询

· 推荐组合产品

1. 奥斯卡DIA蛋白质组 + 奥斯卡DIA棕榈酰化蛋白质组

2. 奥斯卡DIA棕榈酰化蛋白质组 + 代谢组学

· 推荐应用领域

· 全面揭示生理病理条件下的蛋白棕榈酰化特征

· 生理病理分子机制挖掘

· 棕榈酰化和磷酸化/泛素化等修饰的crosstalk

· 送样建议

样品类型		推荐送样量
动物组织类	常规动物组织（脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉、皮肤等）	≥30mg
植物组织类	柔软组织（叶片、幼苗）	≥250mg
细胞样品	悬浮/贴壁培养细胞	≥1.5×10^7
微生物类	细菌类	≥150mg

· 应用案例

1. S Mesquita F, Abrami L, Linder ME, Bamji SX, Dickinson BC, van der Goot FG. Mechanisms and functions of protein S-acylation. Nat Rev Mol Cell Biol. 2024;25(6):488-509.

2. Wan J, Roth AF, Bailey AO, Davis NG. Palmitoylated proteins: purification and identification. Nat Protoc. 2007;2(7):1573-1584.