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转录组测序 • 全转录组
· 产品定义
全转录组(Whole transcriptome)测序,是指特定组织或细胞在特定状态下转录出的所有转录本信息的总和,基于二代测序平台,采用去核糖体链特异性和小片段富集筛选的建库方法,实现编码RNA和非编码RNA(miRNA, lncRNA, circRNA)的建库、测序、生物信息学分析及联合分析、ceRNA调控网络等,研究基因表达变化的同时分析非编码RNA对其调控作用,深入挖掘解读生命现象背后的转录与调控问题。
· 技术路线
· 技术优势
1. 数据丰富:一份样本可同时获得4种RNA(miRNA,lncRNA,mRNA,circRNA)的信息
2. 全面的关联分析:可以进行两两间关联分析和两者以上ceRNA网络调控分析,不仅可以解释生物学现象背后的网络调控机制,而且有助于缩小筛选范围,挖掘关键基因
· 数据分析
· 部分数据分析结果展示
· 推荐应用领域
1. 农林领域:抗逆胁迫机制,生长发育机制,育种保护研究等
2. 微生物领域:致病机理,耐药机制,病原体-宿主相互作用研究等
3. 海洋水产:渔业资源,海水养殖,渔业环境与水产品安全等
4. 基础医学、临床诊断:生物标志物,疾病机理机制,疾病分型,个性化治疗等
· 送样建议
· 应用案例
文献名称:Comprehensive diagnostics of acute myeloid leukemia by whole transcriptome RNA sequencing
发表期刊:《Leukemia》(IF=11.528)
全转录组测序-AML样品-对100例AML患者进行全转录组测序,并通过参考分析和靶向重测序验证HAMLET平台的可靠性。