中医药领域 • 中药肠道微生物研究解决方案
· 产品定义
利用宏基因组、宏代谢组等组学方法,分析中药治疗对菌群及相关活性代谢产物的改善作用,揭示中药通过调控肠道菌群及其代谢物发挥药效的作用机理,发现药效相关的关键菌群及产物。在此基础可进一步提供完整的肠-靶轴多组学:在菌群多组学基础上,进一步结合宿主多组学分析,对菌群-菌群代谢-靶器官信号网络的完整调控体系进行解析。
· 技术路线
1. 16s 扩增子测序: 肠道菌群的多样性研究。通过提取粪便或者内容物样品的DNA,扩增16S rDNA目标区域,通过检测目标区域的序列变异和丰度,获得肠道微生物多样性及群落组成等信息。
2. 宏基因组测序:肠道菌群的多样性及基因功能研究。通过提取粪便或者内容物样品的DNA,构建宏基因组文库,利用基因组学的研究策略同时获得更精细的菌群及功能基因信息。
3. 宏代谢组(G350靶向菌群代谢组): 一次性绝对定量检测350种菌群代谢物,包括胆汁酸、色氨酸代谢、神经递质、TMAO及前体物质、有机酸、维生素等多种菌群相关代谢物。
4. 肠-靶轴整合分析:利用相关性分析、菌群功能数据库与代谢预测模型、机器学习分析等生信分析方法,挖掘与药效相关的关键菌群及菌群代谢物。通过进一步将靶器官信号通路的改变与菌群变化进行整合,获得完整的菌群-靶器官信号的全景信息,并帮助挖掘关键分子机理:
· 技术优势
参考Cell、Nature等高水平研究分析方法;完整解析菌群-菌群代谢通路-菌群代谢物-靶器官信号通路
· 数据分析
· 推荐组合产品
菌群(宏基因组+宏代谢组)+血液(代谢组)+靶器官(转录组/蛋白组/代谢组/修饰组)
· 推荐应用领域
肠-肝轴、肠-神经轴、肠-免疫轴等相关研究
· 送样建议
详见各组学送样建议
· 应用案例
1. Chin Med. 2021 May 1;16(1):37.
2. Circ Res. 2020 Mar 27;126(7):839-853.